RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	LHCGR	P22888	699 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	MYF6	P23409	242 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	ITGB7	P26010	798 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	SERPINB1	P30740	379 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	S100A3	P33764	101 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	ABHD18	Q0P651	414 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	RALGDS	Q12967	914 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	PHKG1	Q16816	387 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	GLYAT	Q6IB77	296 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	OR2T12	Q8NG77	320 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	GTF2H4	Q92759	462 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	GLYATL1	Q969I3	302 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	VOPP1	Q96AW1	172 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	HHIP	Q96QV1	700 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	GDE1	Q9NZC3	331 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	KL	Q9UEF7	1012 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	SUFU	Q9UMX1	484 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442		A0A087WXM4	84 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	GSTA4	O15217	222 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	CLOCK	O15516	846 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	SGTA	O43765	313 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	KCNJ13	O60928	360 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	DNAJB5	O75953	348 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	RPN2	P04844	631 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	CISD3	P0C7P0	127 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	ADH5	P11766	374 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	BCKDHA	P12694	445 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	TEAD1	P28347	426 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	MMP12	P39900	470 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	GSTM5	P46439	218 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	ESRRG	P62508	458 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	PHEX	P78562	749 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	B4GALNT1	Q00973	533 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	MTAP	Q13126	283 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	GK3P	Q14409	553 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	DHCR24	Q15392	516 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	SYTL3	Q4VX76	610 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	SPIN4	Q56A73	249 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	TTC23	Q5W5X9	447 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	SERPINA11	Q86U17	422 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	ITFG1	Q8TB96	612 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	ELMO1	Q92556	727 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	WDR34	Q96EX3	536 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
LETMD1-223	ENST00000550442	OR52E6	Q96RD3	313 aa		11.47	□□□□□ -0.57

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