RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 PIAS1O75925 651 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 C1orf105O95561 183 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 ANKRD34CP0C6C1 535 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 LIFP15018 202 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 PVRP15151 417 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 FOLR1P15328 257 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 NELFEP18615 380 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 CDH3P22223 829 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 CD82P27701 267 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 TNFRSF8P28908 595 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 SSTR1P30872 391 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 TSPAN7P41732 249 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 BDKRB1P46663 353 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 ARL4DP49703 201 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 CLCN7P51798 805 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 PGGT1BP53609 377 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 GUCY2DQ02846 1103 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 CUL1Q13616 776 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 KYNUQ16719 465 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 KLHL38Q2WGJ6 581 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 CCSMST1Q4G0I0 132 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 DCAF12Q5T6F0 453 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 STEAP4Q687X5 459 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 TTC23LQ6PF05 361 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 ZDHHC24Q6UX98 284 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 PRSS42Q7Z5A4 293 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 CCDC25Q86WR0 208 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 MMGT1Q8N4V1 131 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 IL22RA1Q8N6P7 574 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 GIMAP7Q8NHV1 300 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 FBXO25Q8TCJ0 367 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 IL17FQ96PD4 163 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 OR6C1Q96RD1 312 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 FBXO8Q9NRD0 319 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 SPHK1Q9NYA1 384 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 ACTR10Q9NZ32 417 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 MED16Q9Y2X0 877 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 DHRS7Q9Y394 339 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 MED13Q9UHV7 2174 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 PIPSLA2A3N6 862 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 CTAGE15A4D2H0 777 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 TLCD2A6NGC4 264 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 C2orf74A8MZ97 194 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 VPS26AO75436 327 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 RPN2P04844 631 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 EBLN1P0CF75 366 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 CTAGE8P0CG41 777 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 PRKAR1AP10644 381 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 GNLYP22749 145 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 SHMT2P34897 504 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 CDKN2DP55273 166 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 CAV1Q03135 178 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 MGAT5Q09328 741 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 TUBB2AQ13885 445 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 GRB7Q14451 532 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 GBX1Q14549 363 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 COX20Q5RI15 118 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 UNC5DQ6UXZ4 953 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 CEACAM20Q6UY09 585 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 CTAGE6Q86UF2 777 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 TRIM73Q86UV7 250 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 TAX1BP1Q86VP1 789 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 CNTN4Q8IWV2 1026 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 CTAGE4Q8IX94 777 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 FAM20CQ8IXL6 584 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 GPATCH11Q8N954 259 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 MNS1Q8NEH6 495 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 KCNJ9Q92806 393 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 INPP5DQ92835 1189 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 NKD1Q969G9 470 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 RAD51AP1Q96B01 352 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 ABHD17AQ96GS6 310 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 FOPNLQ96NB1 174 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 CATSPER2Q96P56 530 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 OR2A14Q96R47 310 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 CD180Q99467 661 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 TUBB2BQ9BVA1 445 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 SOHLH2Q9NX45 425 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 MOCS1Q9NZB8 636 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 SEMA5BQ9P283 1151 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 POMT2Q9UKY4 750 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 SLC39A10Q9ULF5 831 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 COMMD10Q9Y6G5 202 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 OTOGQ6ZRI0 2925 aa9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms