RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546023.1

TCP1-217, Transcript of t-complex 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TCP1, Length 1,135 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1-217ENST00000546023 ICE2Q659A1 982 aa24.33■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 LCN10Q6JVE6 187 aa24.33■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 SYVN1Q86TM6 617 aa24.33■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 MNS1Q8NEH6 495 aa24.33■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 SEC14L1Q92503 715 aa24.33■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 VPS39Q96JC1 886 aa24.33■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 SELENOSQ9BQE4 189 aa24.33■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 DPH7Q9BTV6 452 aa24.33■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 SMYD2Q9NRG4 433 aa24.33■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 ABCF3Q9NUQ8 709 aa24.33■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 TXNDC16Q9P2K2 825 aa24.33■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 PDE10AQ9Y233 779 aa24.33■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 CDC14CA4D256 554 aa24.32■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 PIAS1O75925 651 aa24.32■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 RAB40ALP0C0E4 278 aa24.32■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 FAM87AP0C7U9 286 aa24.32■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 SAT1P21673 171 aa24.32■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 TBPL1P62380 186 aa24.32■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 YBX1P67809 324 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 DEFB109BQ30KR1 87 aa24.32■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 TCTE1Q5JU00 501 aa24.32■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa24.32■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 C1orf189Q5VU69 101 aa24.32■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 MED8Q96G25 268 aa24.32■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 CCDC138Q96M89 665 aa24.32■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 GBP5Q96PP8 586 aa24.32■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 PARVBQ9HBI1 364 aa24.32■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 RECKO95980 971 aa24.31■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 CCR10P46092 362 aa24.31■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 NCF4Q15080 339 aa24.31■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 PHKG1Q16816 387 aa24.31■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa24.31■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 ZNF285Q96NJ3 590 aa24.31■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa24.31■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 C17orf62Q9BQA9 187 aa24.31■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 NLNQ9BYT8 704 aa24.31■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 SEMA4CQ9C0C4 833 aa24.31■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 SNX7Q9UNH6 387 aa24.31■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 POLHQ9Y253 713 aa24.31■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 A0A0J9YVX5 310 aa24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 CTAGE15A4D2H0 777 aa24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 C1QL1O75973 258 aa24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 CAPN1P07384 714 aa24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 CTAGE8P0CG41 777 aa24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 HIST1H2ADP20671 130 aa24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 MAGEA4P43358 317 aa24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 GCGRP47871 477 aa24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 POLE2P56282 527 aa24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 GPX6P59796 221 aa24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 ABATP80404 500 aa24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 GUCY2DQ02846 1103 aa24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 ZNF460Q14592 562 aa24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 GRM7Q14831 915 aa24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 CTAGE6Q86UF2 777 aa24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 CTAGE4Q8IX94 777 aa24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 MMGT1Q8N4V1 131 aa24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 EXD3Q8N9H8 876 aa24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 KIF18AQ8NI77 898 aa24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 HIST1H2AJQ99878 128 aa24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 PLCD4Q9BRC7 762 aa24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 MCMBPQ9BTE3 642 aa24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 H2AFJQ9BTM1 129 aa24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 FER1L5A0AVI2 2057 aa24.3■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 KALRNO60229 2985 aa24.29■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa24.29■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 FAM159BA6NKW6 160 aa24.29■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 FURINP09958 794 aa24.29■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 STX2P32856 288 aa24.29■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 ARSFP54793 590 aa24.29■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 TAS2R39P59534 338 aa24.29■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 IL10RAQ13651 578 aa24.29■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 UGT8Q16880 541 aa24.29■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 FRMPD2BQ6IN97 320 aa24.29■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 PAQR7Q86WK9 346 aa24.29■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 CPNE1Q99829 537 aa24.29■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 ENAMQ9NRM1 1142 aa24.29■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa24.29■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 TCFL5Q9UL49 500 aa24.29■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 PADI2Q9Y2J8 665 aa24.29■■□□□ 1.48
TCP1-217ENST00000546023 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms