RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523757.5

SNX16-211, Transcript of sorting nexin 16, human

TSL 3

Gene SNX16, Length 682 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNX16-211	ENST00000523757	OR56A3	Q8NH54	315 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	CAVIN3	Q969G5	261 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	KIAA1191	Q96A73	305 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	PTER	Q96BW5	349 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	MIPEP	Q99797	713 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	SGPP1	Q9BX95	441 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	SPRY4	Q9C004	299 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	FAM60A	Q9NP50	221 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	ARL15	Q9NXU5	204 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	11.33	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	TAC3	Q9UHF0	121 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	RAB21	Q9UL25	225 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757		A0A087WV48	116 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757		A0A096LPK6	155 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757		H3BMH7	237 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	SNPH	O15079	494 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	KRT37	O76014	449 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	ANXA5	P08758	320 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	GRIA3	P42263	894 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	HNMT	P50135	292 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	DLG1	Q12959	904 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	RASA2	Q15283	850 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	TGFBI	Q15582	683 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	GPR19	Q15760	415 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	FCRL6	Q6DN72	434 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	ZNF425	Q6IV72	752 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	LCTL	Q6UWM7	567 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	TDRP	Q86YL5	185 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	PDPR	Q8NCN5	879 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	MTBP	Q96DY7	904 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	CTRC	Q99895	268 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	ACOT9	Q9Y305	439 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	CACNA1B	Q00975	2339 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	KERA	O60938	352 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	STK17B	O94768	372 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	NUDT17	P0C025	328 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	HRH2	P25021	359 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	TYK2	P29597	1187 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	HSD17B3	P37058	310 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	ITGA1	P56199	1179 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	RELA	Q04206	551 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	CLN3	Q13286	438 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	NAE1	Q13564	534 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	OR4D1	Q15615	310 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	LGSN	Q5TDP6	509 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	ISCA2	Q86U28	154 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	MREG	Q8N565	214 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	CABS1	Q96KC9	395 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	LRFN5	Q96NI6	719 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	CCDC77	Q9BR77	488 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	HAUS8	Q9BT25	410 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	DPH1	Q9BZG8	443 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SNX16-211	ENST00000523757	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6

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