RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520348.5

SNHG6-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 6, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG6, Length 648 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG6-201ENST00000520348 LINC01555Q8NAE3 123 aa15.5■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 FNDC5Q8NAU1 212 aa15.5■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 ABHD11Q8NFV4 315 aa15.5■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 OR9I1Q8NGQ6 314 aa15.5■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SLC6A18Q96N87 628 aa15.5■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 FERD3LQ96RJ6 166 aa15.5■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 HBEGFQ99075 208 aa15.5■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 TMEM168Q9H0V1 697 aa15.5■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 ACTL8Q9H568 366 aa15.5■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PELI2Q9HAT8 420 aa15.5■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 LRTM1Q9HBL6 345 aa15.5■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 CD320Q9NPF0 282 aa15.5■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 C1orf109Q9NX04 203 aa15.5■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PLAGL1Q9UM63 463 aa15.5■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa15.5■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa15.5■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 LOC100653049A0A140TA62 436 aa15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PDZK1P1A8MUH7 402 aa15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 MEI4A8MW99 385 aa15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 AXIN1O15169 862 aa15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 KRT34O76011 436 aa15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 EML2O95834 649 aa15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 TNFP01375 233 aa15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 F3P13726 295 aa15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 JAK1P23458 1154 aa15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 AK4P27144 223 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 HMGCS1Q01581 520 aa15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 STX5Q13190 355 aa15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PRKG2Q13237 762 aa15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF423Q2M1K9 1284 aa15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PAGE2BQ5JRK9 111 aa15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SLC36A4Q6YBV0 504 aa15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 TMPRSS11BQ86T26 416 aa15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 LONP2Q86WA8 852 aa15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 OR7G3Q8NG95 312 aa15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 OR52E1Q8NGJ3 308 aa15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 C1orf216Q8TAB5 229 aa15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 REPS1Q96D71 796 aa15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 CMTM7Q96FZ5 175 aa15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 NT5DC2Q9H857 520 aa15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SIRT5Q9NXA8 310 aa15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 NDE1Q9NXR1 346 aa15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 ICKQ9UPZ9 632 aa15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 TMED5Q9Y3A6 229 aa15.49■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PIPSLA2A3N6 862 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 DYTNA2CJ06 578 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 OR52A4PA6NMU1 304 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 FBP2O00757 339 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 KDM1AO60341 852 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 EZRP15311 586 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 VARSP26640 1264 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 ACTR1BP42025 376 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 ACTR1AP61163 376 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 RPL38P63173 70 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 RACK1P63244 317 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 CUL3Q13618 768 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 IMPG1Q17R60 797 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 KIF19Q2TAC6 998 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 CATSPEREQ5SY80 951 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 IL23RQ5VWK5 629 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 MED27Q6P2C8 311 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PGM2L1Q6PCE3 622 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SUSD1Q6UWL2 747 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PARGQ86W56 976 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 ARHGAP24Q8N264 748 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 KYQ8NBH2 561 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 FAM13CQ8NE31 585 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 OR4K1Q8NGD4 311 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 CCL4L1Q8NHW4 92 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PROKR1Q8TCW9 393 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 ZFPM2Q8WW38 1151 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 UBE2E3Q969T4 207 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 RCN3Q96D15 328 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 KLHDC7BQ96G42 594 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SPACA7Q96KW9 195 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 EFCAB1Q9HAE3 211 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 CCDC167Q9P0B6 97 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa15.48■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 EML5Q05BV3 1969 aa15.47■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa15.47■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 H0YHG0 523 aa15.47■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 MGRN1O60291 552 aa15.47■□□□□ 0.07
SNHG6-201ENST00000520348 NRP2O60462 931 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms