RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		12.17	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM4	Q9C037	500 aa		12.17	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		12.17	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		12.17	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	12.17	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		12.17	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		12.17	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		12.17	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARGFX	A6NJG6	315 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014		C9J4A7	227 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	CEACAM4	O75871	244 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	TSPAN12	O95859	305 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	IMPA1	P29218	277 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATP1A4	Q13733	1029 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	MLIP	Q5VWP3	458 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	PAQR7	Q86WK9	346 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDIK1L	Q8N165	341 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMPDL3A	Q92484	453 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	CFAP36	Q96G28	342 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	SNF8	Q96H20	258 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	DPH7	Q9BTV6	452 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	NDC1	Q9BTX1	674 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	ING2	Q9H160	280 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	EPN3	Q9H201	632 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	CUTC	Q9NTM9	273 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNF14	Q9UBS8	474 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	12.16	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	FLNC	Q14315	2725 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A0J9YVX5	310 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1B0GX78	115 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMAP	O00193	183 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	DSCR3	O14972	297 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	VPS26A	O75436	327 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	CMPK1	P30085	196 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	HIF1A	Q16665	826 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCTE1	Q5JU00	501 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	ICE2	Q659A1	982 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC39	Q96DD0	335 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	C10orf90	Q96M02	699 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPSB2	Q99619	263 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	OLFM1	Q99784	485 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	TAC3	Q9UHF0	121 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDE10A	Q9Y233	779 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	SNX24	Q9Y343	169 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSAT1	Q9Y617	370 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	COL12A1	Q99715	3063 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SH3BP2-222	ENST00000512014	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SH3BP2-222	ENST00000512014	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SH3BP2-222	ENST00000512014		H0YGG7	62 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SH3BP2-222	ENST00000512014	MASP2	O00187	686 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAD51C	O43502	376 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SH3BP2-222	ENST00000512014	ALAS2	P22557	587 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SH3BP2-222	ENST00000512014	FDXR	P22570	491 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SH3BP2-222	ENST00000512014	HSD17B2	P37059	387 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SH3BP2-222	ENST00000512014	PAFAH1B1	P43034	410 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR1D4	P47884	311 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCL11	P51671	97 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARSF	P54793	590 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARL4C	P56559	192 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47

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