RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	LINC00303	Q3SY05	128 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	MSS51	Q4VC12	460 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	C1orf189	Q5VU69	101 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	ICE2	Q659A1	982 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	MED25	Q71SY5	747 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC25	Q86WR0	208 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF843	Q8N446	348 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	COL26A1	Q96A83	441 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	PTER	Q96BW5	349 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	CABS1	Q96KC9	395 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	HAUS8	Q9BT25	410 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	CUTC	Q9NTM9	273 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	ARL15	Q9NXU5	204 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	CDC23	Q9UJX2	597 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	TLK1	Q9UKI8	766 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	TCFL5	Q9UL49	500 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	HYKK	A2RU49	373 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	GFY	I3L273	518 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	DSCR3	O14972	297 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	RAD51C	O43502	376 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC16A8	O95907	504 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	ALB	P02768	609 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	F8A1	P23610	371 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	OTX2	P32243	289 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	STX2	P32856	288 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	PHB	P35232	272 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	PMS2	P54278	862 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	PLTP	P55058	493 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	STEAP4	Q687X5	459 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	TEX19	Q8NA77	164 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	FKBP10	Q96AY3	582 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	NRTN	Q99748	197 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	MENT	Q9BUN1	341 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	GALP	Q9UBC7	116 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	ITPR1	Q14643	2758 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	ARGFX	A6NJG6	315 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246		E7ESA3	106 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	ALPP	P05187	535 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	ERG	P11308	486 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	PSMB5	P28074	263 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	AVPR1B	P47901	424 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	PGD	P52209	483 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	EMP3	P54852	163 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	RELA	Q04206	551 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	ZIC1	Q15915	447 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	FCRL6	Q6DN72	434 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	C17orf64	Q86WR6	236 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	HPS6	Q86YV9	775 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	10.86	□□□□□ -0.67	1e-8	■■□□□ 11.8

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