RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494664.5

TIMMDC1-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMMDC1, Length 2,394 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-208ENST00000494664 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 RACK1P63244 317 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 MERTKQ12866 999 aa11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 NFATC3Q12968 1075 aa11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 NDUFA5Q16718 116 aa11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 WDR45BQ5MNZ6 344 aa11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 LIPMQ5VYY2 423 aa11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 HMBOX1Q6NT76 420 aa11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 MRNIPQ6NTE8 343 aa11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 TMEM26Q6ZUK4 368 aa11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 DET1Q7L5Y6 550 aa11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 DCLK2Q8N568 766 aa11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 PPP1R36Q96LQ0 422 aa11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 ADI1Q9BV57 179 aa11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 PCDHAC1Q9H158 963 aa11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 FGF22Q9HCT0 170 aa11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 GPR27Q9NS67 375 aa11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 FAM86C1Q9NVL1 165 aa11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 FBXO5Q9UKT4 447 aa11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 CRYL1Q9Y2S2 319 aa11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 PRSS21Q9Y6M0 314 aa11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa11.53□□□□□ -0.56
TIMMDC1-208ENST00000494664 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 A0A096LPK6 155 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 SOCS2O14508 198 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 SCAMP1O15126 338 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 SGTAO43765 313 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 AHSGP02765 367 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 ALOX5P09917 674 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 CKMT2P17540 419 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 CD38P28907 300 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 NUDT1P36639 197 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 CTSCP53634 463 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 CYP2A13Q16696 494 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 CNSTQ6PJW8 725 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 ERMP1Q7Z2K6 904 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 ACVR1CQ8NER5 493 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 PIGKQ92643 395 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 TSNARE1Q96NA8 513 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 COPS8Q99627 209 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 RBBP8Q99708 897 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 OR2AG1Q9H205 316 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 SPAG4Q9NPE6 437 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 FSCN3Q9NQT6 498 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 PRKAB1Q9Y478 270 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 TRPC5OSA6NMA1 111 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 PATE3B3GLJ2 98 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 E7ENX8 843 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 J3QRK9 145 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 PFDN6O15212 129 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 AQP9O43315 295 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 CHRNGP07510 517 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 OGNP20774 298 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 CD247P20963 164 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 TEAD1P28347 426 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 AKT1P31749 480 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 PGGT1BP53609 377 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 SLC36A3Q495N2 470 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 CMC1Q7Z7K0 106 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 CLEC14AQ86T13 490 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 DHFR2Q86XF0 187 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 FBXL8Q96CD0 374 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 PDXPQ96GD0 296 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 MCMBPQ9BTE3 642 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 HGH1Q9BTY7 390 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 C9orf16Q9BUW7 83 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 SMOC1Q9H4F8 434 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 KLF15Q9UIH9 416 aa11.52□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 OR2AG2A6NM03 316 aa11.51□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa11.51□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 CLPXO76031 633 aa11.51□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 RHOBTB1O94844 696 aa11.51□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 CEACAM5P06731 702 aa11.51□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 RABIFP47224 123 aa11.51□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 PCYT1AP49585 367 aa11.51□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 TTPAP49638 278 aa11.51□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 LIMK2P53671 638 aa11.51□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 NFATC4Q14934 902 aa11.51□□□□□ -0.57
TIMMDC1-208ENST00000494664 TCEA2Q15560 299 aa11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms