RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492895.1

ANKRD28-211, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-211ENST00000492895 MIS12Q9H081 205 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 IL21RQ9HBE5 538 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF304Q9HCX3 659 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 Q9N2J8 555 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 SPAG4Q9NPE6 437 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 ABCB8Q9NUT2 735 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 RAB20Q9NX57 234 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 ELOVL2Q9NXB9 296 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 LUZP4Q9P127 313 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 TSPAN16Q9UKR8 245 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 PLA2G4CQ9UP65 541 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 DHDHQ9UQ10 334 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 KIAA1671Q9BY89 1806 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 AKAP13Q12802 2813 aa3.23□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 NLRC5Q86WI3 1866 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM149AA5PLN7 773 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 TRIM49BA6NDI0 452 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 YJEFN3A6XGL0 299 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 E7ENQ6 273 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 M0QYV0 167 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 TBL1XO60907 577 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 PENKP01210 267 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 IFNA2P01563 188 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 CD59P13987 128 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 HLA-FP30511 346 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 GTF2H1P32780 548 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 CD70P32970 193 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 ACSL1P33121 698 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 DPP6P42658 865 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 PRCPP42785 496 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 HTR6P50406 440 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 TPMTP51580 245 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 SGSHP51688 502 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 P2RX3P56373 397 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 STX17P56962 302 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 C21orf59P57076 290 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 RPS24P62847 133 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 NUCB2P80303 420 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 BST2Q10589 180 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 GRIK2Q13002 908 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 KIF19Q2TAC6 998 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 HLA-BQ31612 363 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 ODF3L2Q3SX64 289 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 POM121L1PQ3SYA9 428 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 MPPE1Q53F39 396 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 SPDYCQ5MJ68 293 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 ENTPD8Q5MY95 495 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 ASPHD1Q5U4P2 390 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 ARHGAP17Q68EM7 881 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 CCDC186Q7Z3E2 898 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 NAXDQ8IW45 347 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 MFN1Q8IWA4 741 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 CARNMT1Q8N4J0 409 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC25A41Q8N5S1 370 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 DPP10Q8N608 796 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 ANKRD52Q8NB46 1076 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 OR2T3Q8NH03 318 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 ASB5Q8WWX0 329 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 SMARCE1Q969G3 411 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 SH3KBP1Q96B97 665 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM149B1Q96BN6 582 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 FRG2BQ96QU4 278 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 GABRG3Q99928 467 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 NUP58Q9BVL2 599 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 DCLK3Q9C098 648 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 LHX5Q9H2C1 402 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 GAREM1Q9H706 876 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 RMND1Q9NWS8 449 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 CLIC5Q9NZA1 410 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 COX16Q9P0S2 106 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 GGA2Q9UJY4 613 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF510Q9Y2H8 683 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-211ENST00000492895 APC2O95996 2303 aa3.21□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms