RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CKAP2Q8WWK9 683 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 PATE1Q8WXA2 126 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 MAGEB18Q96M61 343 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CD180Q99467 661 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 EHD1Q9H4M9 534 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CCDC134Q9H6E4 229 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 MANSC1Q9H8J5 431 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 ANKMY1Q9P2S6 941 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 ICKQ9UPZ9 632 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 FAM149AA5PLN7 773 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 OR5K3A6NET4 321 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 E2F3O00716 465 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CLGNO14967 610 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 SUPT7LO94864 414 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 UBXN7O94888 489 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 WDR47O94967 919 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 OTCP00480 354 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CDK4P11802 303 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 AMD1P17707 334 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 GNAZP19086 355 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 ACP1P24666 158 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 MDH1P40925 334 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 HSPA7P48741 367 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 ATP1A2P50993 1020 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 PKNOX1P55347 436 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 TBPL1P62380 186 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 DAB2P98082 770 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 RELAQ04206 551 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CDC16Q13042 620 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 STX3Q13277 289 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 ILKQ13418 452 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 SLC5A12Q1EHB4 618 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 FRMD7Q6ZUT3 714 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 GLRX5Q86SX6 157 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 TAX1BP1Q86VP1 789 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 OR4E2Q8NGC2 313 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 LRRC8CQ8TDW0 803 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 RHBDD1Q8TEB9 315 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 DCBLD2Q96PD2 775 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 TMEM237Q96Q45 408 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 TMEM79Q9BSE2 394 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 NTMT1Q9BV86 223 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 DRC3Q9H069 523 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 THAP1Q9NVV9 213 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 KCNK4Q9NYG8 393 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 FTSJ1Q9UET6 329 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 PCTPQ9UKL6 214 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 DYRK1BQ9Y463 629 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 RNF215Q9Y6U7 377 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 OR6C74A6NCV1 312 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 TRABD2BA6NFA1 517 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 HGSO14964 777 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 DUX1O43812 170 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 C1QL1O75973 258 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 EBLN1P0CF75 366 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 NPPBP16860 134 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CXCR2P25025 360 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CMPK1P30085 196 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CASP2P42575 452 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CAPZBP47756 277 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 HK2P52789 917 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CLCQ05315 142 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 ZNF33BQ06732 778 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 LCP2Q13094 533 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 LAPTM5Q13571 262 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 GTF2H2Q13888 395 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 E2F2Q14209 437 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 RCN2Q14257 317 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 CHI3L2Q15782 390 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 TBCCQ15814 346 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 UNC50Q53HI1 259 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 LIPJQ5W064 366 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-211ENST00000488243 C17orf64Q86WR6 236 aa11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms