RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486388.5

UBP1-210, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 3

Gene UBP1, Length 928 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-210	ENST00000486388		Q8NA96	180 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	NACC2	Q96BF6	587 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	C19orf60	Q96EN9	201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	RUFY1	Q96T51	708 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ISCU	Q9H1K1	167 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	BTRC	Q9Y297	605 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68	5e-7	■□□□□ 10.5
UBP1-210	ENST00000486388	BSN	Q9UPA5	3926 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	MED13	Q9UHV7	2174 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	LRRD1	A4D1F6	860 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	MGAT4D	A6NG13	374 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	OR2AG2	A6NM03	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	C2orf81	A6NN90	581 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PRSS44	E7EML9	344 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388		F8W8V4	182 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	AGPS	O00116	658 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	LRRTM2	O43300	516 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF749	O43361	778 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PMPCB	O75439	489 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	KCNH1	O95259	989 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	FSHB	P01225	129 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	EPO	P01588	193 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CYP1A2	P05177	515 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	POLB	P06746	335 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CD48	P09326	243 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TCF4	P15884	667 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ITGA3	P26006	1051 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PRKCI	P41743	596 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CASP6	P55212	293 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PPP1CA	P62136	330 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	POU4F1	Q01851	419 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	OCRL	Q01968	901 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	NFE2L1	Q14494	772 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	LLGL1	Q15334	1064 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	VWA2	Q5GFL6	755 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	DCAF10	Q5QP82	559 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SARM1	Q6SZW1	724 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GPR150	Q8NGU9	434 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	OR2L2	Q8NH16	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	DLG3	Q92796	817 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PTER	Q96BW5	349 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	IQCD	Q96DY2	449 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CNDP1	Q96KN2	507 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	AGAP4	Q96P64	663 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GBP5	Q96PP8	586 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GBP4	Q96PP9	640 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SYT11	Q9BT88	431 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	NDC1	Q9BTX1	674 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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