RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484179.5

USP34-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 927 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-215	ENST00000484179	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	BLK	P51451	505 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	TPMT	P51580	245 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	MYL6	P60660	151 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	ST8SIA6	P61647	398 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	OLR1	P78380	273 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	MC1R	Q01726	317 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	HLA-B	Q31612	363 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	FUT11	Q495W5	492 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	MPP7	Q5T2T1	576 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	ATL3	Q6DD88	541 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	KDM1B	Q8NB78	822 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	OR2T3	Q8NH03	318 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	FAR1	Q8WVX9	515 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	KCNK16	Q96T55	309 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	GPR174	Q9BXC1	333 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	MKLN1	Q9UL63	735 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	NUP205	Q92621	2012 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	THADA	Q6YHU6	1953 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	PTPRJ	Q12913	1337 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	SCN1A	P35498	2009 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	LRRC72	A6NJI9	287 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	PDXK	O00764	312 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	YEATS4	O95619	227 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	IRF1	P10914	325 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	KRT13	P13646	458 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	TFEB	P19484	476 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	EDN2	P20800	178 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	POU1F1	P28069	291 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	NNMT	P40261	264 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	ARSF	P54793	590 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	MFAP3	P55082	362 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	UCN	P55089	124 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	C21orf59	P57076	290 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	MAP3K7CL	P57077	242 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	ASIC1	P78348	528 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	INCA1	Q0VD86	236 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	OVGP1	Q12889	678 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	STK38	Q15208	465 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	TTI2	Q6NXR4	508 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	SZRD1	Q7Z422	152 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	CCDC25	Q86WR0	208 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	LSMEM2	Q8N112	164 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	DEFB119	Q8N690	84 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	FRMD1	Q8N878	549 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	DDI1	Q8WTU0	396 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	WBP1	Q96G27	269 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	LHX5	Q9H2C1	402 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP34-215	ENST00000484179	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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