RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 CPNE1Q99829 537 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 SELENOSQ9BQE4 189 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 SMYD2Q9NRG4 433 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A0J9YVX5 310 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 C9J4A7 227 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 TERTO14746 1132 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 PIAS1O75925 651 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 IMPA1P29218 277 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 STX2P32856 288 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 PGGT1BP53609 377 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 GPX6P59796 221 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 ABATP80404 500 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 PTCHD3Q3KNS1 767 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 ICE2Q659A1 982 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 RHBDD2Q6NTF9 364 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 BORAQ6PGQ7 559 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 CEP112Q8N8E3 955 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 C17orf62Q9BQA9 187 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM117AQ9C073 453 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 ACTL8Q9H568 366 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 ANKMY1Q9P2S6 941 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 SNX7Q9UNH6 387 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 KLK4Q9Y5K2 254 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM159BA6NKW6 160 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 H3BMH7 237 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 RECKO95980 971 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 RAB40ALP0C0E4 278 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 ALAS2P22557 587 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 GP5P40197 560 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 TAS2R39P59534 338 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 POU4F1Q01851 419 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 GRM7Q14831 915 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 DEFB109BQ30KR1 87 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 LINC00303Q3SY05 128 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 C1orf189Q5VU69 101 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 PROKR1Q8TCW9 393 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 IFT81Q8WYA0 676 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 TSPAN17Q96FV3 270 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 PLCD4Q9BRC7 762 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 NLNQ9BYT8 704 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM129AQ9BZQ8 928 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 PCBD2Q9H0N5 130 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 ARL15Q9NXU5 204 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 NDOR1Q9UHB4 597 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 CDC14CA4D256 554 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 CTSVO60911 334 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 TSPAN12O95859 305 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 CTSBP07858 339 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 ATXN8OSP0DMR3 200 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 SPRP35270 261 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 CCR10P46092 362 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 AP1S2P56377 157 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 YBX1P67809 324 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 DCDP81605 110 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 LY6DQ14210 128 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 USP10Q14694 798 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM214AQ32MH5 1076 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 WASHC2DQ5SRD0 308 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 GRTP1Q5TC63 336 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 MLIPQ5VWP3 458 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 LCN10Q6JVE6 187 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 AGTRAPQ6RW13 159 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 PCSK4Q6UW60 755 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 ADCK2Q7Z695 626 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 SYVN1Q86TM6 617 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 PPM1NQ8N819 430 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 FBF1Q8TES7 1133 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 MED8Q96G25 268 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 RUFY1Q96T51 708 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 TSPYL1Q9H0U9 437 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 ATG10Q9H0Y0 220 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 GPAMQ9HCL2 828 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC6A20Q9NP91 592 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 POLHQ9Y253 713 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 OR2A25A4D2G3 310 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4-209ENST00000484097 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms