RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FLRT1Q9NZU1 646 aa16.18■□□□□ 0.18
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GALTP07902 379 aa16.18■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STK19P49842 368 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNS3Q9BQ31 491 aa16.18■□□□□ 0.18
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TAC3Q9UHF0 121 aa16.18■□□□□ 0.18
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KDELR3O43731 214 aa16.18■□□□□ 0.18
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UPK3BL2E5RIL1 263 aa16.17■□□□□ 0.18
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AHI1Q8N157 1196 aa16.17■□□□□ 0.18
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMURF2Q9HAU4 748 aa16.17■□□□□ 0.18
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPR32O75388 356 aa16.17■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CD36P16671 472 aa16.17■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CPN2P22792 545 aa16.17■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SCARB2Q14108 478 aa16.17■□□□□ 0.18
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCAF4L2Q8NA75 395 aa16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNJ9Q92806 393 aa16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PSKH2Q96QS6 385 aa16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa16.16■□□□□ 0.18
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1W2PQY0 241 aa16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 J3QRK9 145 aa16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC30A4O14863 429 aa16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCNDBP1O95273 360 aa16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EPOP01588 193 aa16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TIE1P35590 1138 aa16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP16.16■□□□□ 0.182e-9■■■■□ 22.8
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLHDC10Q6PID8 442 aa16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C5orf34Q96MH7 638 aa16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERI3O43414 337 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRKAR1AP10644 381 aa16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GLDCP23378 1020 aa16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OMPP47874 163 aa16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR2T5Q6IEZ7 315 aa16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC17Q8N6Y2 441 aa16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR2T29Q8NH02 315 aa16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WDR26Q9H7D7 661 aa16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TPT1P8Q9HAU6 139 aa16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CRB2Q5IJ48 1285 aa16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C22orf39Q6P5X5 142 aa16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TTC9BQ8N6N2 239 aa16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SCAIQ8N9R8 606 aa16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPR151Q8TDV0 419 aa16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM203Q969S6 136 aa16.16■□□□□ 0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TBX5Q99593 518 aa16.16■□□□□ 0.18
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