RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		14.21	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	ARGFX	A6NJG6	315 aa		14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	NRP2	O60462	931 aa		14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	PIAS1	O75925	651 aa		14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	FKBP9	O95302	570 aa		14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	HIST1H2AD	P20671	130 aa		14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	GABRA4	P48169	554 aa		14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	SLC12A2	P55011	1212 aa		14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	IL2	P60568	153 aa		14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	SLC7A5	Q01650	507 aa		14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	IL10RA	Q13651	578 aa		14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	GRM7	Q14831	915 aa		14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	NAA25	Q14CX7	972 aa		14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	NCF4	Q15080	339 aa		14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	STEAP4	Q687X5	459 aa		14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF480	Q8WV37	535 aa		14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	NLN	Q9BYT8	704 aa		14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	TCFL5	Q9UL49	500 aa		14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	14.2	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	PCSK5	Q92824	1860 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PPV9	198 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	TARM1	B6A8C7	271 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	CTSV	O60911	334 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	C8G	P07360	202 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	SSTR1	P30872	391 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	ARSF	P54793	590 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	UGT8	Q16880	541 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	TCTE1	Q5JU00	501 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	ICE2	Q659A1	982 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	CDKL2	Q92772	493 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	CABS1	Q96KC9	395 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	OLFM1	Q99784	485 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	CUTC	Q9NTM9	273 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	CDC23	Q9UJX2	597 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	VWA7	Q9Y334	891 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	PSAT1	Q9Y617	370 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		14.19	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	14.18	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	ESYT3	A0FGR9	886 aa		14.18	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880		E7ENX8	843 aa		14.18	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		14.18	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	GFY	I3L273	518 aa		14.18	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	TP73	O15350	636 aa		14.18	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	SLC28A2	O43868	658 aa		14.18	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	RFPL1	O75677	317 aa		14.18	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	DNAJB5	O75953	348 aa		14.18	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	GUCA1C	O95843	209 aa		14.18	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	ERG	P11308	486 aa		14.18	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	IMPA1	P29218	277 aa		14.18	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	FOLR3	P41439	243 aa		14.18	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	TBPL1	P62380	186 aa		14.18	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	TAP2	Q03519	686 aa		14.18	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF460	Q14592	562 aa		14.18	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	14.18	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	DUPD1	Q68J44	220 aa		14.18	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	RAB43	Q86YS6	212 aa		14.18	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	PLD3	Q8IV08	490 aa		14.18	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	THAP4	Q8WY91	577 aa		14.18	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	14.18	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC138	Q96M89	665 aa		14.18	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	GBP5	Q96PP8	586 aa		14.18	□□□□□ -0.14
SSR4-208	ENST00000471880	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		14.18	□□□□□ -0.14

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