RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 CDC7O00311 574 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 ABHD2P08910 425 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 NAE1Q13564 534 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 PPP1R3AQ16821 1122 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 TCTE1Q5JU00 501 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF425Q6IV72 752 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 FBXO42Q6P3S6 717 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR155Q7Z3F1 870 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 VASH2Q86V25 355 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC38A9Q8NBW4 561 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 OR56A3Q8NH54 315 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC44A1Q8WWI5 657 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 PLCD4Q9BRC7 762 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 SGPP1Q9BX95 441 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 TXLNGYQ9BZA5 131 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 CPNE5Q9HCH3 593 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC6A20Q9NP91 592 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 OARD1Q9Y530 152 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 CACNA1BQ00975 2339 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 HMX2A2RU54 273 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 MEN1O00255 615 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 TERTO14746 1132 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF749O43361 778 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 CTSVO60911 334 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC166P0CW27 439 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 LIFP15018 202 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 TNFRSF8P28908 595 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 RORAP35398 523 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 PMS2P54278 862 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 YBX1P67809 324 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 CXADRP78310 365 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 CDKL4Q5MAI5 379 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 TEX35Q5T0J7 233 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 LCTLQ6UWM7 567 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF44Q7L0R7 432 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 PAQR7Q86WK9 346 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 DSELQ8IZU8 1212 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC45A3Q96JT2 553 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 ATG10Q9H0Y0 220 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM184CQ9NVA4 438 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 WDR70Q9NW82 654 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 SRPK3Q9UPE1 567 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 LHX6Q9UPM6 363 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 PKD1L2Q7Z442 2459 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 C21orf140B9A014 251 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 KRT37O76014 449 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 RECKO95980 971 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 ANXA5P08758 320 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM153BP0C7A2 387 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 CD1DP15813 335 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 NPPBP16860 134 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 GCGRP47871 477 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 HNMTP50135 292 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 SERPINB9P50453 376 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 CSRP3P50461 194 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 ARSFP54793 590 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 TBPL1P62380 186 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 GPS2Q13227 327 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 TSNQ15631 228 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 DEFB110Q30KQ9 67 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM153CQ494X1 144 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 MROH9Q5TGP6 573 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 RHBDD2Q6NTF9 364 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 RAPH1Q70E73 1250 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 PROKR1Q8TCW9 393 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 KIAA1191Q96A73 305 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 CLIP3Q96DZ5 547 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 CRELD1Q96HD1 420 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 SELENOSQ9BQE4 189 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 HAUS8Q9BT25 410 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR87Q9BY21 358 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 PCMTD2Q9NV79 361 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF180Q9UJW8 692 aa16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms