RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 LTBP2Q14767 1821 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 ANXA5P08758 320 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 CDH3P22223 829 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 RPIAP49247 311 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 BCL2L1Q07817 233 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 CDH18Q13634 790 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM16LQ309B1 348 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 RFX4Q33E94 735 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 PERM1Q5SV97 790 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 NIPAL1Q6NVV3 410 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 SNX29P2Q8IUI4 249 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 OR7A2PQ8NGA2 310 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 RORBQ92753 470 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 RMND5AQ9H871 391 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
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SH3BP1-202ENST00000417536 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 INSL5Q9Y5Q6 135 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 BACE2Q9Y5Z0 518 aa18.16■□□□□ 0.5
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SH3BP1-202ENST00000417536 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 TSPAN33Q86UF1 283 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 APCDD1Q8J025 514 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
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SH3BP1-202ENST00000417536 NEURL2Q9BR09 285 aa18.16■□□□□ 0.5
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SH3BP1-202ENST00000417536 ELOVL6Q9H5J4 265 aa18.16■□□□□ 0.5
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SH3BP1-202ENST00000417536 hCG_2039718K7EN88 272 aa18.16■□□□□ 0.5
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SH3BP1-202ENST00000417536 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
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SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF846Q147U1 533 aa18.16■□□□□ 0.5
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SH3BP1-202ENST00000417536 OR4F3Q6IEY1 312 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF165Q6ZSG1 346 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 NDNFQ8TB73 568 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 GLMNQ92990 594 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC29A3Q9BZD2 475 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 OR51B4Q9Y5P0 310 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 RFXANKO14593 260 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 SERPINB7O75635 380 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGEF15O94989 841 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 ITGAMP11215 1152 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 DAPP51397 102 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 IL18R1Q13478 541 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 MACC1Q6ZN28 852 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 OVCA2Q8WZ82 227 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 HTATIP2Q9BUP3 242 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC32A1Q9H598 525 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 RDH14Q9HBH5 336 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT87PA6NCN2 255 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 WNT9AO14904 365 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 SDC1P18827 310 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 CLK3P49761 638 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 ERVFC1P60507 584 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 ADPRMQ3LIE5 342 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 TTLL9Q3SXZ7 439 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF697Q5TEC3 545 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 NXPE1Q8N323 547 aa18.15■□□□□ 0.5
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SH3BP1-202ENST00000417536 ZFP90Q8TF47 636 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 ARMC5Q96C12 935 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 APIPQ96GX9 242 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 APOLD1Q96LR9 279 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 HMG20AQ9NP66 347 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-202ENST00000417536 M0R3G1 203 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 RFPL2O75678 378 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 GABRR2P28476 465 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 SPAM1P38567 509 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 VBP1P61758 197 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNC4Q03721 635 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 C1orf53Q5VUE5 145 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF175Q8N4F7 328 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAJB8Q8NHS0 232 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 CPQQ9Y646 472 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PRU2 124 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 UPK3BL1B0FP48 263 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 UPK3BL2E5RIL1 263 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 CCL16O15467 120 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAJB5O75953 348 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 GABARAPO95166 117 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
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