RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KCNK13Q9HB14 408 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GPAMQ9HCL2 828 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BPIFA1Q9NP55 256 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IL26Q9NPH9 171 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TAS2R13Q9NYV9 303 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KLQ9UEF7 1012 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HAO1Q9UJM8 370 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CRYL1Q9Y2S2 319 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa9.26□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RGSL1A5PLK6 1076 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DPM1O60762 260 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CREG1O75629 220 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRAMEF1O95521 474 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCDC166P0CW27 439 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CD99P14209 185 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TIMP2P16035 220 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ITGALP20701 1170 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SAT1P21673 171 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LHCGRP22888 699 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 VIPR1P32241 457 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SERPINB5P36952 375 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC1A6P48664 564 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DCDC1P59894 354 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PTSQ03393 145 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NFATC2Q13469 925 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CSHL1Q14406 222 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IRF4Q15306 451 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GALNTL6Q49A17 601 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF805Q5CZA5 627 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LRRC73Q5JTD7 316 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CTSL3PQ5NE16 218 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LIPMQ5VYY2 423 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ISCA2Q86U28 154 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TSPAN33Q86UF1 283 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CRLF3Q8IUI8 442 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANKRD49Q8WVL7 239 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 STON2Q8WXE9 905 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KCNJ9Q92806 393 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PNPLA2Q96AD5 504 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KLHL32Q96NJ5 620 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TTC1Q99614 292 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRIM8Q9BZR9 551 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DERL2Q9GZP9 239 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM168Q9H0V1 697 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM96AQ9H5X1 160 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SYTL2Q9HCH5 934 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RAD18Q9NS91 495 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SMOXQ9NWM0 555 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 XPR1Q9UBH6 696 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 B4GALT6Q9UBX8 382 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OSGIN2Q9Y236 505 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR1A2Q9Y585 309 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LRP4O75096 1905 aa9.25□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa9.24□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A0U1RQS6 177 aa9.24□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARGFXA6NJG6 315 aa9.24□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C16orf96A6NNT2 1141 aa9.24□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 F8W8V4 182 aa9.24□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 H3BMM5 538 aa9.24□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TOR1BO14657 336 aa9.24□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ITM2AO43736 263 aa9.24□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DLX3O60479 287 aa9.24□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NPHS1O60500 1241 aa9.24□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DNAJC6O75061 913 aa9.24□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 VPS26AO75436 327 aa9.24□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DCTN3O75935 186 aa9.24□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TM7SF2O76062 418 aa9.24□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KIAA0754O94854 1291 aa9.24□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC4A1P02730 911 aa9.24□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PYGLP06737 847 aa9.24□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 COX6B1P14854 86 aa9.24□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CD1DP15813 335 aa9.24□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF28P17035 718 aa9.24□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ACRV1P26436 265 aa9.24□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HTR1BP28222 390 aa9.24□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FMO4P31512 558 aa9.24□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARRB2P32121 409 aa9.24□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPINT3P49223 89 aa9.24□□□□□ -0.93
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HK2P52789 917 aa9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms