RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRSS33Q8NF86 280 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 TSPAN14Q8NG11 270 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 CFAP61Q8NHU2 1237 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 GATAD1Q8WUU5 269 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 AGAP4Q96P64 663 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPAG5Q96R06 1193 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC3Q9BQI4 270 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 MTMR12Q9C0I1 747 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 NYXQ9GZU5 481 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 TLE6Q9H808 572 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 MED20Q9H944 212 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 MYNNQ9NPC7 610 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 HAO2Q9NYQ3 351 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC24A2Q9UI40 661 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAN1B1Q9UKM7 699 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP2.53□□□□□ -2
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 GLOD5A6NK44 160 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 EPM2AB3EWF7 344 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 FPGTO14772 594 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 SH3BP5O60239 455 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 IRF2P14316 349 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACTN2P35609 894 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 PGFP49763 221 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 LIG4P49917 911 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 EIF5P55010 431 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 GUCY2DQ02846 1103 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 PAX8Q06710 450 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 RIGQ13278 110 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 MTF1Q14872 753 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 NOTUMQ6P988 496 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 KIF6Q6ZMV9 814 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 CHMP1BQ7LBR1 199 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 ERC1Q8IUD2 1116 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 NDUFAF2Q8N183 169 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 AQP11Q8NBQ7 271 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC37A3Q8NCC5 494 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR7A2PQ8NGA2 310 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR4K1Q8NGD4 311 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 MIPOL1Q8TD10 442 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATL1Q8WXF7 558 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 FOXN4Q96NZ1 517 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 GCNAQ96QF7 691 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 LPAR4Q99677 370 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 MXD3Q9BW11 206 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC106Q9BWC9 280 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRRG4Q9BZD6 226 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 KLHL4Q9C0H6 718 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZMYND12Q9H0C1 365 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 CHKBQ9Y259 395 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A1W2PPE2 198 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A1W2PR64 198 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 PI4K2BG5E9Z4 385 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 H0YAE9 185 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 GFPT2O94808 682 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGHV3-13P01766 116 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 PTGER4P35408 488 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 PTGER3P43115 390 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 DNA2P51530 1060 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 MYL7Q01449 175 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 PEX6Q13608 980 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDH18Q13634 790 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 EXT1Q16394 746 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 HYIQ5T013 277 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM198BQ6UWH4 519 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 FRRS1Q6ZNA5 592 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 METTL4Q8N3J2 472 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 TTC30BQ8N4P2 665 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 TEKT4Q8WW24 435 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC45A3Q96JT2 553 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 C4orf45Q96LM5 186 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 GAL3ST4Q96RP7 486 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 ABHD1Q96SE0 405 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC68Q9H2F9 335 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 NDE1Q9NXR1 346 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPS6KA6Q9UK32 745 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 RNF150Q9ULK6 438 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 WDR83OSQ9Y284 106 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms