RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376227.3

CCDC22-201, Transcript of coiled-coil domain containing 22, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC22, Length 2,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22-201ENST00000376227 COPS8Q99627 209 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 REEP1Q9H902 201 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 ANKHQ9HCJ1 492 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 KRT84Q9NSB2 600 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 GPRC5BQ9NZH0 403 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 HCSTQ9UBK5 93 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 PPT2Q9UMR5 302 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 BACE2Q9Y5Z0 518 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 TMEM221A6NGB7 291 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 K7ERQ8 282 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 CLIC1O00299 241 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 FPGTO14772 594 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 MAN1A2O60476 641 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 LRATO95237 230 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 FKBP9O95302 570 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 EPORP19235 508 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 ACVR2AP27037 513 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 SERPINA4P29622 427 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 INAQ16352 499 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 GPR162Q16538 588 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 CDKN3Q16667 212 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 ADPRMQ3LIE5 342 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 CEP68Q76N32 757 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 PRSS48Q7RTY5 328 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 ATG16L2Q8NAA4 619 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 NDNFQ8TB73 568 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 ASIC4Q96FT7 647 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 APOLD1Q96LR9 279 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 SLC12A9Q9BXP2 914 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 SERTM1A2A2V5 107 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 KRBA1A5PL33 1030 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 AGAP14A8MT82 685 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 TOR1BO14657 336 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 CA12O43570 354 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 NTRK1P04629 796 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 SELPP16109 830 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 AMD1P17707 334 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 RPL17P18621 184 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 TACR1P25103 407 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 KDELR2P33947 212 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 MAP2K4P45985 399 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 NEK2P51955 445 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 MTAPQ13126 283 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 PROX2Q3B8N5 592 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 PLEKHG6Q3KR16 790 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 PERM1Q5SV97 790 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 KIAA1841Q6NSI8 718 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 SYT12Q8IV01 421 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 ZFP90Q8TF47 636 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 STARD8Q92502 1023 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 ALG14Q96F25 216 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 TMEM247A6NEH6 219 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 TBKBP1A7MCY6 615 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 MAGEB17A8MXT2 336 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 hCG_2039718K7EN88 272 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 FADS2O95864 444 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 MT-ND2P03891 347 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 ENGP17813 658 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 VBP1P61758 197 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 ZNF33BQ06732 778 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 SP140Q13342 867 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 DGCR6Q14129 220 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 PAGE2BQ5JRK9 111 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 FRG2Q64ET8 278 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 NOXRED1Q6NXP6 359 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 NEK5Q6P3R8 708 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 PLD3Q8IV08 490 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 DBF4BQ8NFT6 615 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 APIPQ96GX9 242 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 FRG2BQ96QU4 278 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 ACOT13Q9NPJ3 140 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 FBXO10Q9UK96 956 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 WDR37Q9Y2I8 494 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 SLC10A3P09131 477 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 GPX2P18283 190 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 CYP2A7P20853 494 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 LSM3P62310 102 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 LAPTM4AQ15012 233 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 ZNF621Q6ZSS3 439 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 CBLL1Q75N03 491 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 BTLAQ7Z6A9 289 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 ZZZ3Q8IYH5 903 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 FCGR1BQ92637 280 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 HHIPQ96QV1 700 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC22-201ENST00000376227 LYSMD1Q96S90 227 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms