RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CITED2-201ENST00000367651 SLC32A1Q9H598 525 aa18.24■□□□□ 0.51
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CITED2-201ENST00000367651 KIF17Q9P2E2 1029 aa18.24■□□□□ 0.51
CITED2-201ENST00000367651 OR51B4Q9Y5P0 310 aa18.24■□□□□ 0.51
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