RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 KCT2Q8NC54 265 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 C1orf74Q96LT6 269 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 ZSWIM3Q96MP5 696 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 C1orf21Q9H246 121 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 TAC3Q9UHF0 121 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-203ENST00000366687 DAPL1A0PJW8 107 aa19.77■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 SOD2P04179 222 aa19.77■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 GNALP38405 381 aa19.77■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 FRMD7Q6ZUT3 714 aa19.77■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 LMO3Q8TAP4 145 aa19.77■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 ABI3Q9P2A4 366 aa19.77■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 MED31Q9Y3C7 131 aa19.77■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 PGLSO95336 258 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 KLK1P06870 262 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 GNSP15586 552 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 OR2T5Q6IEZ7 315 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 UTS2BQ765I0 119 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 OR2T29Q8NH02 315 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 ACTR3BQ9P1U1 418 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 DUOX1Q9NRD9 1551 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGDIBP52566 201 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 GANABQ14697 944 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 ZFP69Q49AA0 526 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 OVCA2Q8WZ82 227 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 DPYSL5Q9BPU6 564 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 MANBAO00462 879 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 RGS20O76081 388 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 ABHD18Q0P651 414 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 DUOXA1Q1HG43 343 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 BORCS6Q96GS4 357 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRA2Q9H9E1 313 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 AMBNQ9NP70 447 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 CYP11A1P05108 521 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 CASP9P55211 416 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 TYSND1Q2T9J0 566 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF554Q86TJ5 538 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 IQCHQ86VS3 1027 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 PIK3R3Q92569 461 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 FBXL12Q9NXK8 326 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 F7P08709 466 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 GSTM3P21266 225 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 DGKEP52429 567 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 TAS2R50P59544 299 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 ABATP80404 500 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 GPRC6AQ5T6X5 926 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 SLC39A3Q9BRY0 314 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 ERVK-11Q9UQG0 969 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 C8BP07358 591 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 GDF5P43026 501 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 OLIG2Q13516 323 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 SATL1Q86VE3 508 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB26Q9HCK0 441 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 PHF24Q9UPV7 400 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 XKP51811 444 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 CDK6Q00534 326 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 TGFBIQ15582 683 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 ELOA3BQ3SY89 546 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 ELOA3Q8NG57 546 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 OR6K6Q8NGW6 343 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 PCYT2Q99447 389 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 TCF7L1Q9HCS4 588 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0J9YVX5 310 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 RFC2P35250 354 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 ALDH3A2P51648 485 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 NXPE1Q8N323 547 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00471Q8N535 108 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 FAM46DQ8NEK8 389 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 NEUROD4Q9HD90 331 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 ANXA2P2A6NMY6 339 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 MMP20O60882 483 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 H1F0P07305 194 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 SP140Q13342 867 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 FAM182AQ5T1J6 154 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 FATE1Q969F0 183 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 POPDC3Q9HBV1 291 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 CLDND1Q9NY35 253 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 MATN2O00339 956 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 RHDQ02161 417 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-203ENST00000366687 EMX2Q04743 252 aa19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.1 ms