RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338045.7

LIMS1-202, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-202ENST00000338045 SH2B3Q9UQQ2 575 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 DYRK1BQ9Y463 629 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 A0A1W2PPC4 97 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SLC22A3O75751 556 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 G6PDP11413 515 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 VARSP26640 1264 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 NME5P56597 212 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SRP54P61011 504 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 UFM1P61960 85 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 RPL38P63173 70 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ART3Q13508 389 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ALG11Q2TAA5 492 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 COQ5Q5HYK3 327 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 WASHC2DQ5SRD0 308 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 CYP20A1Q6UW02 462 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 HACD2Q6Y1H2 254 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PARP9Q8IXQ6 854 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 FRMD1Q8N878 549 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PJA1Q8NG27 643 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 OR13H1Q8NG92 308 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SLC5A11Q8WWX8 675 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 RLN3Q8WXF3 142 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 CMTM7Q96FZ5 175 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 CLPTM1LQ96KA5 538 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 FERD3LQ96RJ6 166 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 HAUS8Q9BT25 410 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 EFCAB11Q9BUY7 163 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TPSD1Q9BZJ3 242 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PRDM8Q9NQV8 689 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SLC7A8Q9UHI5 535 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 DGKBQ9Y6T7 804 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 HSD3B1P14060 373 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ACPPP15309 386 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 CAPN3P20807 821 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 HSD3B2P26439 372 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 RPS9P46781 194 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 RPE65Q16518 533 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 CATSPEREQ5SY80 951 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 NXPE4Q6UWF7 544 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 OR7G3Q8NG95 312 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SMPDL3AQ92484 453 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 CAMK1GQ96NX5 476 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 CXorf56Q9H5V9 222 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 BRF2Q9HAW0 419 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TBC1D29Q9UFV1 150 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 NDUFAF1Q9Y375 327 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 A0A1W2PPV9 198 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 FAM234BA2RU67 622 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 OR52A4PA6NMU1 304 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 NR5A2O00482 541 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 MRASO14807 208 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SCAMP1O15126 338 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SEC22BO75396 215 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PCSK2P16519 638 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 JAK1P23458 1154 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 IL12AP29459 219 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 MMEL1Q495T6 779 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 MED27Q6P2C8 311 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 LPCAT2Q7L5N7 544 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 RETREG3Q86VR2 466 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 LAS2Q8IYD9 372 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 FAM174AQ8TBP5 190 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SPDL1Q96EA4 605 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 FCRL1Q96LA6 429 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PCBD2Q9H0N5 130 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TMEM168Q9H0V1 697 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PCED1AQ9H1Q7 454 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 WDR41Q9HAD4 459 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TMED5Q9Y3A6 229 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 A6NCN8 305 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ATP6V1G2O95670 118 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 AK4P27144 223 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PKLRP30613 574 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 RAB28P51157 221 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 MTTPP55157 894 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 VPS26BQ4G0F5 336 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMS1-202ENST00000338045 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms