RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283875.5

GTF2E1-201, Transcript of general transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2E1, Length 3,012 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1-201ENST00000283875 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 SMURF1Q9HCE7 757 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 EMC7Q9NPA0 242 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 SCN3BQ9NY72 215 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 MARK1Q9P0L2 795 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 COPZ2Q9P299 210 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 SESN1Q9Y6P5 492 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 TISP43B9A030 160 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 SOCS7O14512 581 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 ANKRD28O15084 1053 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 SEC22BO75396 215 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 PAGE1O75459 146 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 TNFRSF21O75509 655 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 GPX5O75715 221 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 LCKP06239 509 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 CSF3P09919 207 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 ACSL1P33121 698 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 LIG4P49917 911 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 CLCN4P51793 760 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 EPHA4P54764 986 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 DNAJB13P59910 316 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 CSNK2BP67870 215 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 PUDPQ08623 228 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 PRSS36Q5K4E3 855 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 PDZK1Q5T2W1 519 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 CYHR1Q6ZMK1 362 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 RTL4Q6ZR62 310 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 NECAB2Q7Z6G3 386 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 CCDC116Q8IYX3 515 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 KLHL36Q8N4N3 616 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 RDH13Q8NBN7 331 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 OR1M1Q8NGA1 313 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 UBASH3BQ8TF42 649 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 ARNTL2Q8WYA1 636 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 LPAR1Q92633 364 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 TUBGCP3Q96CW5 907 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 LRRC58Q96CX6 371 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 ART5Q96L15 291 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 PPP1R36Q96LQ0 422 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.262e-9■■■■□ 20.2
GTF2E1-201ENST00000283875 PTDSS2Q9BVG9 487 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 ELOVL6Q9H5J4 265 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 PDGFCQ9NRA1 345 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 DNAJB9Q9UBS3 223 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 FEM1BQ9UK73 627 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa7.19□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 DOCK5Q9H7D0 1870 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 OGTO15294 1046 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 FADS2O95864 444 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 LALBAP00709 142 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 ADRB2P07550 413 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 JUPP14923 745 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 SPI1P17947 270 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 KCNA5P22460 613 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 ITGB8P26012 769 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 CALCRP30988 508 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 SOX11P35716 441 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 CD96P40200 585 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 AKR1D1P51857 326 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 ATP12AP54707 1039 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 YBX1P67809 324 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 PSPHP78330 225 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 HOXC5Q00444 222 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 RAPSNQ13702 412 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 UGCGQ16739 394 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 FKBP1CQ5VVH2 108 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 PKN3Q6P5Z2 889 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 OR52E4Q8NGH9 312 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 TCEAL3Q969E4 200 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 PPP3R2Q96LZ3 170 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 QRFPRQ96P65 431 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 DPH7Q9BTV6 452 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
GTF2E1-201ENST00000283875 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms