RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000248139.7

RAB40C-201, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB40C, Length 2,699 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-201ENST00000248139 IGFBP5P24593 272 aa24.8■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 AQP1P29972 269 aa24.8■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 VLDLRP98155 873 aa24.8■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 FRG2Q64ET8 278 aa24.8■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 C22orf39Q6P5X5 142 aa24.8■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 BTLAQ7Z6A9 289 aa24.8■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 SMYD1Q8NB12 490 aa24.8■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 FIBINQ8TAL6 211 aa24.8■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 FKBP10Q96AY3 582 aa24.8■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 FRG2BQ96QU4 278 aa24.8■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 TBC1D23Q9NUY8 699 aa24.8■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 ERVK-18Q9QC07 812 aa24.8■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 CLIC1O00299 241 aa24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 FPGTO14772 594 aa24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 NUDT7P0C024 238 aa24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 KIR3DL1P43629 444 aa24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 DAPP51397 102 aa24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 UGT8Q16880 541 aa24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 SMU1Q2TAY7 513 aa24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 TMEM25Q86YD3 366 aa24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 SYT12Q8IV01 421 aa24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 ELMO1Q92556 727 aa24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 LATS1O95835 1130 aa24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 PPP3CCP48454 512 aa24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 GSSP48637 474 aa24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 MPPE1Q53F39 396 aa24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 SLC39A11Q8N1S5 342 aa24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 BORCS5Q969J3 196 aa24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 TMEM9Q9P0T7 183 aa24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 SNX5Q9Y5X3 404 aa24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 SLC6A12P48065 614 aa24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 SPINT3P49223 89 aa24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 ABHD18Q0P651 414 aa24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 CCDC81Q6ZN84 652 aa24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 PXYLP1Q8TE99 480 aa24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 CMTM7Q96FZ5 175 aa24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 RDH12Q96NR8 316 aa24.79■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 PRPS2P11908 318 aa24.78■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 MAPK8P45983 427 aa24.78■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 PFN3P60673 137 aa24.78■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 Q6ZVL8 140 aa24.78■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 FAM217AQ8IXS0 508 aa24.78■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 TCEAL8Q8IYN2 117 aa24.78■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 TERB1Q8NA31 727 aa24.78■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 RAB2BQ8WUD1 216 aa24.78■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 SORCS1Q8WY21 1168 aa24.78■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 MED8Q96G25 268 aa24.78■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 ZNF558Q96NG5 402 aa24.78■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 CHD7Q9P2D1 2997 aa24.78■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 WNT9AO14904 365 aa24.78■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 FKBP9O95302 570 aa24.78■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 ANGPTL1O95841 491 aa24.78■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 CBSLP0DN79 551 aa24.78■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 CBSP35520 551 aa24.78■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 DEFB103AP81534 67 aa24.78■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 FKBP9P1Q75LS8 142 aa24.78■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa24.78■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 SNX29P2Q8IUI4 249 aa24.78■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 MAL2Q969L2 176 aa24.78■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 LYSMD1Q96S90 227 aa24.78■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 RASSF1Q9NS23 344 aa24.78■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 GMEB1Q9Y692 573 aa24.78■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 E7EQ34 232 aa24.77■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 LEFTY2O00292 366 aa24.77■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 PCMT1P22061 227 aa24.77■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 CSNK1DP48730 415 aa24.77■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 CLK3P49761 638 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 IRF8Q02556 426 aa24.77■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 DGCR6Q14129 220 aa24.77■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 MOGQ16653 247 aa24.77■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 MCOLN3Q8TDD5 553 aa24.77■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 TPD52L3Q96J77 140 aa24.77■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 DNAJC11Q9NVH1 559 aa24.77■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 ORC6Q9Y5N6 252 aa24.77■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 KCNK5O95279 499 aa24.77■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 ETHE1O95571 254 aa24.77■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 LAMP1P11279 417 aa24.77■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 COX7A2P14406 83 aa24.77■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 PREPP48147 710 aa24.77■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 CCR3P51677 355 aa24.77■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 XKR6Q5GH73 641 aa24.77■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 HTR3DQ70Z44 454 aa24.77■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa24.77■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 ECHDC3Q96DC8 303 aa24.77■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 SLC46A2Q9BY10 475 aa24.77■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 FAIMQ9NVQ4 179 aa24.77■■□□□ 1.56
RAB40C-201ENST00000248139 EVPLLA8MZ36 301 aa24.76■■□□□ 1.55
RAB40C-201ENST00000248139 NTRK1P04629 796 aa24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms