RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 FAM57AQ8TBR7 257 aa15.59■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF398Q8TD17 642 aa15.59■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 OLFM3Q96PB7 478 aa15.59■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM5Q9C035 493 aa15.59■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 LCMT1Q9UIC8 334 aa15.59■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 TEKT2Q9UIF3 430 aa15.59■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa15.58■□□□□ 0.09
SPCS1-201ENST00000233025 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa15.58■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 LRRD1A4D1F6 860 aa15.58■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 TPOP07202 933 aa15.58■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 CXCR2P25025 360 aa15.58■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 DLX5P56178 289 aa15.58■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 AP2B1P63010 937 aa15.58■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 MESDQ14696 234 aa15.58■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 TCTE1Q5JU00 501 aa15.58■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 RNFT1Q5M7Z0 435 aa15.58■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC70Q6NSX1 233 aa15.58■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 KDELC1Q6UW63 502 aa15.58■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 NPNTQ6UXI9 565 aa15.58■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ZZZ3Q8IYH5 903 aa15.58■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 CLYBLQ8N0X4 340 aa15.58■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ACRBPQ8NEB7 543 aa15.58■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 IMMP1LQ96LU5 166 aa15.58■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF700Q9H0M5 742 aa15.58■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF304Q9HCX3 659 aa15.58■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP15.58■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ATE1O95260 518 aa15.57■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 TPM3P06753 285 aa15.57■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 PTGER1P34995 402 aa15.57■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 EMP2P54851 167 aa15.57■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 PTPRCAPQ14761 206 aa15.57■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 KIR2DS3Q14952 304 aa15.57■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 OR1C1Q15619 314 aa15.57■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM211Q6ICI0 200 aa15.57■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa15.57■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 CDC20BQ86Y33 519 aa15.57■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 RPRMLQ8N4K4 120 aa15.57■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 SLC35G2Q8TBE7 412 aa15.57■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 RND1Q92730 232 aa15.57■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 SEC16BQ96JE7 1060 aa15.57■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 HACD3Q9P035 362 aa15.57■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 GNPTGQ9UJJ9 305 aa15.57■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 HEY1Q9Y5J3 304 aa15.57■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa15.56■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ISM1B1AKI9 464 aa15.56■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 APOL1O14791 398 aa15.56■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 RAF1P04049 648 aa15.56■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF24P17028 368 aa15.56■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 CHRNA4P43681 627 aa15.56■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 RPA4Q13156 261 aa15.56■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 FAM214AQ32MH5 1076 aa15.56■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 SIRPB2Q5JXA9 342 aa15.56■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa15.56■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM178AQ8NBL3 297 aa15.56■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 OR8K1Q8NGG5 319 aa15.56■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 COX4I2Q96KJ9 171 aa15.56■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 CHP1Q99653 195 aa15.56■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 SPTLC3Q9NUV7 552 aa15.56■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 UBP1Q9NZI7 540 aa15.56■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 PKP3Q9Y446 797 aa15.56■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 RCCD1A6NED2 376 aa15.55■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 AGAP14A8MT82 685 aa15.55■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 KRT1P04264 644 aa15.55■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ICAM2P13598 275 aa15.55■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 CD96P40200 585 aa15.55■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 GRIA3P42263 894 aa15.55■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 EFNA3P52797 238 aa15.55■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 AP1B1Q10567 949 aa15.55■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM14Q14142 442 aa15.55■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ACER2Q5QJU3 275 aa15.55■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 SPINK14Q6IE38 97 aa15.55■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 PRMT9Q6P2P2 845 aa15.55■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa15.55■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 PWWP2AQ96N64 755 aa15.55■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 SELENOSQ9BQE4 189 aa15.55■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ASB8Q9H765 288 aa15.55■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ABHD10Q9NUJ1 306 aa15.55■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD10Q9NXR5 420 aa15.55■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 PLAGL1Q9UM63 463 aa15.55■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa15.55■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 INAFM1C9JVW0 142 aa15.54■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 CBFA2T2O43439 604 aa15.54■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 SRP72O76094 671 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 NUDT7P0C024 238 aa15.54■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 CD46P15529 392 aa15.54■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 FBLP22087 321 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 PTGS2P35354 604 aa15.54■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ST13P50502 369 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF75DP51815 510 aa15.54■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 PDK1Q15118 436 aa15.54■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC38Q5VT99 294 aa15.54■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 FCRLBQ6BAA4 426 aa15.54■□□□□ 0.08
SPCS1-201ENST00000233025 H3F3CQ6NXT2 135 aa15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms