RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 CKAP5Q14008 2032 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 CCDC154A6NI56 674 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 LRRC72A6NJI9 287 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 NR5A2O00482 541 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 CFLARO15519 480 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 PDE5AO76074 875 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 PRPS2P11908 318 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 CD22P20273 847 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 MAPK1P28482 360 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 IL12AP29459 219 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 DPP6P42658 865 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TPMTP51580 245 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 CLCNKAP51800 687 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 THOP1P52888 689 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TBPL1P62380 186 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 RPL38P63173 70 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 HMGCS1Q01581 520 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TDGQ13569 410 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 LAPTM5Q13571 262 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 CEACAM7Q14002 265 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 CYP2A13Q16696 494 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 LEXMQ3ZCV2 418 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 PYCR3Q53H96 274 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 XKR6Q5GH73 641 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 PAGE2BQ5JRK9 111 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 ATG9BQ674R7 924 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 LCTLQ6UWM7 567 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 SYTL1Q8IYJ3 562 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TBC1D21Q8IYX1 336 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 REPS1Q96D71 796 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TEX37Q96LM6 180 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 ANKRD27Q96NW4 1050 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 HAUS8Q9BT25 410 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 EFCAB11Q9BUY7 163 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 C1orf50Q9BV19 199 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 BTBD1Q9H0C5 482 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 PCBD2Q9H0N5 130 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC6A17Q9H1V8 727 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 BRF2Q9HAW0 419 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 STOML1Q9UBI4 398 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 CD300AQ9UGN4 299 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 ASF1AQ9Y294 204 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 DYRK1BQ9Y463 629 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 CDH23Q9H251 3354 aa9.23□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 KANSL1LA0AUZ9 987 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 E7EQ34 232 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 FXYD1O00168 92 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 ACOT8O14734 319 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 LATO43561 262 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 NARSO43776 548 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 PRMT3O60678 531 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 SEC22BO75396 215 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 KRT36O76013 467 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 APBB3O95704 486 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 FUCA1P04066 466 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 ASGR2P07307 311 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC35G4P0C7Q5 338 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 NPPBP16860 134 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 GABRG2P18507 467 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 DGKEP52429 567 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 NME5P56597 212 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 CLDN8P56748 225 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 C21orf58P58505 322 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 PPP2CBP62714 309 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 AP2B1P63010 937 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 PPP2CAP67775 309 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 PRKCQQ04759 706 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC34A1Q06495 639 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 CCNIQ14094 377 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 NFATC4Q14934 902 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 RCN1Q15293 331 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 SGO1Q5FBB7 561 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 NXPE4Q6UWF7 544 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 WASH2PQ6VEQ5 465 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF852Q6ZMS4 543 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 ARPINQ7Z6K5 226 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 LAS2Q8IYD9 372 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 DNAJB8Q8NHS0 232 aa9.22□□□□□ -0.93
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC5A11Q8WWX8 675 aa9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.4 ms