RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440		Q6ZVL8	140 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	BRF1	Q92994	677 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	TNFRSF25	Q93038	417 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	PHF21A	Q96BD5	680 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	EXOC2	Q96KP1	924 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	DUX5	Q96PT3	197 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	SIK2	Q9H0K1	926 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	MPP6	Q9NZW5	540 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	COX16	Q9P0S2	106 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	HESX1	Q9UBX0	185 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC188	H7C350	402 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	KPNA5	O15131	536 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	EPHB6	O15197	1021 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PIP5K1C	O60331	668 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PROC	P04070	461 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	CTSB	P07858	339 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PRSS56	P0CW18	603 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF23	P17027	643 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	GAP43	P17677	238 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	OMG	P23515	440 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ACVRL1	P37023	503 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	OR1D4	P47884	311 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PRR20E	P86478	221 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PRR20C	P86479	221 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PRR20D	P86480	221 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PRR20B	P86481	221 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PRR20A	P86496	221 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PTP4A2	Q12974	167 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	STIM1	Q13586	685 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PSMD6	Q15008	389 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	DAAM2	Q86T65	1068 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	TEX29	Q8N6K0	151 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	EXD1	Q8NHP7	514 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	AP2M1	Q96CW1	435 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	C18orf8	Q96DM3	657 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PLIN2	Q99541	437 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	BEX1	Q9HBH7	125 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	CD84	Q9UIB8	345 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	MID2	Q9UJV3	735 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	AHRR	A9YTQ3	701 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	VWC2L	B2RUY7	222 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	BTN3A1	O00481	513 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	NUAK1	O60285	661 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	SASH3	O75995	380 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	IGLV3-25	P01717	112 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	HEXB	P07686	556 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	HLA-DPA1	P20036	260 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	SERPINA4	P29622	427 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	RGS7	P49802	495 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	TAS2R50	P59544	299 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB35	Q15286	201 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	TAZ	Q16635	292 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	5.76	□□□□□ -1.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.4 ms