RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613424.4

IRF1-211, Transcript of interferon regulatory factor 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene IRF1, Length 821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1-211ENST00000613424 OARD1Q9Y530 152 aa16.01■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 A0A087X1B8 175 aa16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 A0A096LPK6 155 aa16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 TRIM49D1C9J1S8 452 aa16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 TAF4O00268 1085 aa16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 MAP3K7O43318 606 aa16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 FKBP9O95302 570 aa16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 SHBGP04278 402 aa16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 MAGP20916 626 aa16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 HSD17B3P37058 310 aa16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 SLC26A3P40879 764 aa16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 SERPINB8P50452 374 aa16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 YBX1P67809 324 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 IL11RAQ14626 422 aa16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 FIGLAQ6QHK4 219 aa16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 CEACAM20Q6UY09 585 aa16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 CCDC91Q7Z6B0 441 aa16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 OR2L3Q8NG85 312 aa16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 ISL2Q96A47 359 aa16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 NXNL1Q96CM4 212 aa16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 ATG10Q9H0Y0 220 aa16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 FGF21Q9NSA1 209 aa16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 IGSF5Q9NSI5 407 aa16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 ABCF3Q9NUQ8 709 aa16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 FETUBQ9UGM5 382 aa16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 RAB21Q9UL25 225 aa16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 ADAMTS20P59510 1910 aa16■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 KRT37O76014 449 aa15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 FGF5P12034 268 aa15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 GRIA3P42263 894 aa15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 MAGEA12P43365 314 aa15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 IRF9Q00978 393 aa15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 TUBB3Q13509 450 aa15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 NAE1Q13564 534 aa15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 OR4D1Q15615 310 aa15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 GPR19Q15760 415 aa15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 LGSNQ5TDP6 509 aa15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 FCRL6Q6DN72 434 aa15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 EMBQ6PCB8 327 aa15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 ISCA2Q86U28 154 aa15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 PROSER1Q86XN7 944 aa15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 CAVIN3Q969G5 261 aa15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 KIAA1191Q96A73 305 aa15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 ZUFSPQ96AP4 578 aa15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 PTERQ96BW5 349 aa15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 FBXL8Q96CD0 374 aa15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 MED8Q96G25 268 aa15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 ZPBPQ9BS86 351 aa15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 NMRAL1Q9HBL8 299 aa15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 TAC3Q9UHF0 121 aa15.99■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 TARM1B6A8C7 271 aa15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 ANXA5P08758 320 aa15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 MSL3P1P0C860 447 aa15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 CMPK1P30085 196 aa15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 KCNC1P48547 511 aa15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 CDKL1Q00532 357 aa15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 TGFBIQ15582 683 aa15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 ICE2Q659A1 982 aa15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 CYB5D1Q6P9G0 228 aa15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 FRA10AC1Q70Z53 315 aa15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 PPP1R3BQ86XI6 285 aa15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 GPSM1Q86YR5 675 aa15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 DNAJC22Q8N4W6 341 aa15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 OR56A3Q8NH54 315 aa15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 STAG3L4Q8TBR4 150 aa15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 KCTD4Q8WVF5 259 aa15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 ATL1Q8WXF7 558 aa15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 VPS11Q9H270 941 aa15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 ACSL6Q9UKU0 697 aa15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 RARRES3Q9UL19 164 aa15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 KLK4Q9Y5K2 254 aa15.98■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 ZFHX4Q86UP3 3567 aa15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 HCRTR1O43613 425 aa15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 KLHL2O95198 593 aa15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 TUBBP07437 444 aa15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 TFEBP19484 476 aa15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 CD82P27701 267 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms