RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 C2orf74A8MZ97 194 aa18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 H3BMM5 538 aa18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 LRRTM2O43300 516 aa18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 NIPSNAP2O75323 286 aa18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 BANF1O75531 89 aa18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 SLCO2B1O94956 709 aa18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 EBLN1P0CF75 366 aa18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 FOLR1P15328 257 aa18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 PGAM1P18669 254 aa18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 CHRM3P20309 590 aa18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 ETF1P62495 437 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 CTBP1Q13363 440 aa18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 KYNUQ16719 465 aa18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 BBS9Q3SYG4 887 aa18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF789Q5FWF6 425 aa18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 SYT10Q6XYQ8 523 aa18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 CARFQ8N187 725 aa18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 ZADH2Q8N4Q0 377 aa18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 CLEC1AQ8NC01 280 aa18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 FAM136AQ96C01 138 aa18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 TRIM31Q9BZY9 425 aa18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 C1GALT1Q9NS00 363 aa18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 ACTR10Q9NZ32 417 aa18.51■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 CROCCQ5TZA2 2017 aa18.5■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa18.5■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 E5RI56 91 aa18.5■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 S1PR4O95977 384 aa18.5■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 RPN2P04844 631 aa18.5■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 F7P08709 466 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 PKMP14618 531 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 ADARP55265 1226 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 MORF4L2Q15014 288 aa18.5■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 MSS51Q4VC12 460 aa18.5■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 UNC5DQ6UXZ4 953 aa18.5■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 UNC5AQ6ZN44 842 aa18.5■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 DENND6AQ8IWF6 608 aa18.5■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 D2HGDHQ8N465 521 aa18.5■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 CALML6Q8TD86 181 aa18.5■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 CHST8Q9H2A9 424 aa18.5■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 FAM169AQ9Y6X4 670 aa18.5■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 TPBGLP0DKB5 382 aa18.49■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 SLC1A2P43004 574 aa18.49■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 GLRBP48167 497 aa18.49■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 ITGA8P53708 1063 aa18.49■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 GPS2Q13227 327 aa18.49■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 CRYMQ14894 314 aa18.49■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa18.49■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa18.49■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 LMNTD2Q8IXW0 634 aa18.49■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 PDIK1LQ8N165 341 aa18.49■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 SNF8Q96H20 258 aa18.49■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 PWWP2AQ96N64 755 aa18.49■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC68Q9H2F9 335 aa18.49■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 OR6C2Q9NZP2 312 aa18.49■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 CIDEBQ9UHD4 219 aa18.49■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 EFCAB8A8MWE9 144 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 SMAPO00193 183 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 MEN1O00255 615 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 MAP3K7O43318 606 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 TTC4O95801 387 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 ST6GAL1P15907 406 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 MYBPC3Q14896 1274 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 GPR19Q15760 415 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 SPANXN3Q5MJ09 141 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 TTC23LQ6PF05 361 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 SPESP1Q6UW49 350 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 KCNMB4Q86W47 210 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 DSELQ8IZU8 1212 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 ZBTB2Q8N680 514 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 C17orf62Q9BQA9 187 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 FAM167BQ9BTA0 163 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 NAT9Q9BTE0 207 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 DHRS4Q9BTZ2 278 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 KLHL25Q9H0H3 589 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 SYTL2Q9HCH5 934 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 CHST11Q9NPF2 352 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 SPHK1Q9NYA1 384 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 GALPQ9UBC7 116 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 COPG2Q9UBF2 871 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 FBXO5Q9UKT4 447 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 BTRCQ9Y297 605 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-208ENST00000608287 NFS1Q9Y697 457 aa18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms