RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592358.1

UBXN6-208, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 2

Gene UBXN6, Length 626 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-208ENST00000592358 PNLIPRP1P54315 467 aa15.27■□□□□ 0.04
UBXN6-208ENST00000592358 BNIP1Q12981 228 aa15.27■□□□□ 0.04
UBXN6-208ENST00000592358 KRT33BQ14525 404 aa15.27■□□□□ 0.04
UBXN6-208ENST00000592358 ARHGAP19Q14CB8 494 aa15.27■□□□□ 0.04
UBXN6-208ENST00000592358 KRT72Q14CN4 511 aa15.27■□□□□ 0.04
UBXN6-208ENST00000592358 DUOXA1Q1HG43 343 aa15.27■□□□□ 0.04
UBXN6-208ENST00000592358 ALG11Q2TAA5 492 aa15.27■□□□□ 0.04
UBXN6-208ENST00000592358 UAP1L1Q3KQV9 507 aa15.27■□□□□ 0.04
UBXN6-208ENST00000592358 TPRG1LQ5T0D9 272 aa15.27■□□□□ 0.04
UBXN6-208ENST00000592358 HID1Q8IV36 788 aa15.27■□□□□ 0.04
UBXN6-208ENST00000592358 PHC3Q8NDX5 983 aa15.27■□□□□ 0.04
UBXN6-208ENST00000592358 ZNF480Q8WV37 535 aa15.27■□□□□ 0.04
UBXN6-208ENST00000592358 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
UBXN6-208ENST00000592358 PYCR2Q96C36 320 aa15.27■□□□□ 0.04
UBXN6-208ENST00000592358 CDK15Q96Q40 435 aa15.27■□□□□ 0.04
UBXN6-208ENST00000592358 FERD3LQ96RJ6 166 aa15.27■□□□□ 0.04
UBXN6-208ENST00000592358 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa15.27■□□□□ 0.04
UBXN6-208ENST00000592358 MVB12BQ9H7P6 319 aa15.27■□□□□ 0.04
UBXN6-208ENST00000592358 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
UBXN6-208ENST00000592358 GPRC5BQ9NZH0 403 aa15.27■□□□□ 0.04
UBXN6-208ENST00000592358 CIDEBQ9UHD4 219 aa15.27■□□□□ 0.04
UBXN6-208ENST00000592358 POLG2Q9UHN1 485 aa15.27■□□□□ 0.04
UBXN6-208ENST00000592358 ZNF225Q9UK10 706 aa15.27■□□□□ 0.04
UBXN6-208ENST00000592358 BTRCQ9Y297 605 aa15.27■□□□□ 0.04
UBXN6-208ENST00000592358 DYRK1BQ9Y463 629 aa15.27■□□□□ 0.04
UBXN6-208ENST00000592358 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa15.27■□□□□ 0.04
UBXN6-208ENST00000592358 DGKBQ9Y6T7 804 aa15.27■□□□□ 0.04
UBXN6-208ENST00000592358 ACACBO00763 2458 aa15.27■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 LRP4O75096 1905 aa15.26■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 KRT87PA6NCN2 255 aa15.26■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 UGDHO60701 494 aa15.26■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 KCNK5O95279 499 aa15.26■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 KRT6AP02538 564 aa15.26■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 KRT6BP04259 564 aa15.26■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 GNSP15586 552 aa15.26■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 MAOBP27338 520 aa15.26■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 KRT6CP48668 564 aa15.26■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 CTBSQ01459 385 aa15.26■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP15.26■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 GGTA1PQ4G0N0 100 aa15.26■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 SLC23A3Q6PIS1 610 aa15.26■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 WASH2PQ6VEQ5 465 aa15.26■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa15.26■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 SLC6A18Q96N87 628 aa15.26■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 CCDC106Q9BWC9 280 aa15.26■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa15.26■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 WASH6PQ9NQA3 447 aa15.26■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 SLC6A14Q9UN76 642 aa15.26■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 SLC12A4Q9UP95 1085 aa15.26■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 CAPN7Q9Y6W3 813 aa15.26■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 C4orf47A7E2U8 309 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 SCAMP1O15126 338 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 SLC22A2O15244 555 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 LINC00032P0C843 101 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 ENGP17813 658 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 ACTR1BP42025 376 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 RASSF2P50749 326 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 BLKP51451 505 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 ACTR1AP61163 376 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 TBPL1P62380 186 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 IRF8Q02556 426 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 LIPJQ5W064 366 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 IL27RAQ6UWB1 636 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 RNF165Q6ZSG1 346 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 L3MBTL4Q8NA19 623 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 MFSD2AQ8NA29 543 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 PPFIBP2Q8ND30 876 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 TUBGCP3Q96CW5 907 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 NSL1Q96IY1 281 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 MIPEPQ99797 713 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 ORAI3Q9BRQ5 295 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 GSDMCQ9BYG8 508 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 TMEM9BQ9NQ34 198 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 GPR27Q9NS67 375 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 ARMCX1Q9P291 453 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 SNX6Q9UNH7 406 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 WDR37Q9Y2I8 494 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 RNF11Q9Y3C5 154 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 KCNE2Q9Y6J6 123 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 ABCA7Q8IZY2 2146 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 CEP192Q8TEP8 1941 aa15.24■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 SLC28A1O00337 649 aa15.24■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 UBDO15205 165 aa15.24■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
UBXN6-208ENST00000592358 LBPP18428 481 aa15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms