RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589318.5

DDX39A-209, Transcript of DExD-box helicase 39A, human

TSL 1 (best)

Gene DDX39A, Length 1,903 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX39A-209	ENST00000589318	TMEM159	Q96B96	161 aa		14.98	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	THAP11	Q96EK4	314 aa		14.98	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	NEURL2	Q9BR09	285 aa		14.98	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	IPPK	Q9H8X2	491 aa		14.98	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	GPR34	Q9UPC5	381 aa		14.98	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	BTRC	Q9Y297	605 aa		14.98	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		14.98	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		14.97	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318		K7EPI3	171 aa		14.97	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	EPOR	P19235	508 aa		14.97	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	CD72	P21854	359 aa		14.97	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	PIK3R1	P27986	724 aa		14.97	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	TRIM23	P36406	574 aa		14.97	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	CCR3	P51677	355 aa		14.97	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	IRF4	Q15306	451 aa		14.97	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		14.97	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		14.97	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		14.97	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		14.97	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		14.97	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	KLK6	Q92876	244 aa		14.97	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	ISOC1	Q96CN7	298 aa		14.97	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		14.97	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	DOK1	Q99704	481 aa		14.97	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	TEX101	Q9BY14	249 aa		14.97	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		14.97	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	OPTC	Q9UBM4	332 aa		14.97	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	GSTT2	P0CG29	244 aa		14.96	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	GSTT2B	P0CG30	244 aa		14.96	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	CYP2A7	P20853	494 aa		14.96	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	TEAD1	P28347	426 aa		14.96	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC6A12	P48065	614 aa		14.96	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	AP1S2	P56377	157 aa		14.96	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	ABR	Q12979	859 aa		14.96	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	XKR7	Q5GH72	579 aa		14.96	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	KRT80	Q6KB66	452 aa		14.96	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		14.96	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		14.96	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		14.96	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	GANC	Q8TET4	914 aa		14.96	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM3C	Q92520	227 aa		14.96	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	CD93	Q9NPY3	652 aa		14.96	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		14.96	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		14.96	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		14.96	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	POLG2	Q9UHN1	485 aa		14.96	□□□□□ -0.01
DDX39A-209	ENST00000589318	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		14.96	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318		A0A1W2PQU0	124 aa		14.96	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	STK16	O75716	305 aa		14.96	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	OTC	P00480	354 aa		14.96	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	LINC00032	P0C843	101 aa		14.96	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	SRF	P11831	508 aa		14.96	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	HNMT	P50135	292 aa		14.96	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	GTF2H3	Q13889	308 aa		14.96	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	INPP5A	Q14642	412 aa		14.96	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	FBXO43	Q4G163	708 aa		14.96	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		14.96	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		14.96	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		14.96	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	OR2L2	Q8NH16	312 aa		14.96	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		14.96	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		14.96	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		14.96	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	FZD4	Q9ULV1	537 aa		14.96	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	SCML1	Q9UN30	329 aa		14.96	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	PRR23A	A6NEV1	266 aa		14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TRIM64B	A6NI03	449 aa		14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	CAPN1	P07384	714 aa		14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	PRR35	P0CG20	571 aa		14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	NDUFV2	P19404	249 aa		14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	HIST1H2AD	P20671	130 aa		14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	RGS21	Q2M5E4	152 aa		14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TTC23L	Q6PF05	361 aa		14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	C16orf87	Q6PH81	154 aa		14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	USP30	Q70CQ3	517 aa		14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	KY	Q8NBH2	561 aa		14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	MSANTD3	Q96H12	275 aa		14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		14.95	□□□□□ -0.02
DDX39A-209	ENST00000589318	CCDC138	Q96M89	665 aa		14.95	□□□□□ -0.02

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