RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 RFPL1O75677 317 aa31.91■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 COL6A2P12110 1019 aa31.91■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 ETV5P41161 510 aa31.91■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 TBPL1P62380 186 aa31.91■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACAP2Q15057 778 aa31.91■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLC3Q6P597 504 aa31.91■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPSM1Q86YR5 675 aa31.91■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 EGFL8Q99944 293 aa31.91■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACAT2Q9BWD1 397 aa31.91■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP31.91■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLHL25Q9H0H3 589 aa31.91■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATG10Q9H0Y0 220 aa31.91■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 EURLQ9NYK6 297 aa31.91■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF112Q9ULX5 631 aa31.91■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASPMQ8IZT6 3477 aa31.91■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMIM23A6NLE4 172 aa31.9■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNFSF15O95150 251 aa31.9■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCND1P24385 295 aa31.9■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 HNMTP50135 292 aa31.9■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAPK10P53779 464 aa31.9■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 SH3BP2P78314 561 aa31.9■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 MC2RQ01718 297 aa31.9■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMTC4Q5T4D3 741 aa31.9■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM20CQ8IXL6 584 aa31.9■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 RHEBL1Q8TAI7 183 aa31.9■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 MZB1Q8WU39 189 aa31.9■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 MIPEPQ99797 713 aa31.9■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDE7BQ9NP56 450 aa31.9■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXO8Q9NRD0 319 aa31.9■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAC3Q9UHF0 121 aa31.9■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 BRINP1O60477 761 aa31.9■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAGP20916 626 aa31.9■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB15P59190 212 aa31.9■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 NAE1Q13564 534 aa31.9■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDKL4Q5MAI5 379 aa31.9■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa31.9■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYB5D1Q6P9G0 228 aa31.9■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 MED8Q96G25 268 aa31.9■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCTN2Q96GX1 697 aa31.9■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 KERAO60938 352 aa31.89■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 CMPK1P30085 196 aa31.89■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNAB1Q14722 419 aa31.89■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP31.89■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa31.89■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP31.89■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR56A3Q8NH54 315 aa31.89■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR78Q96P69 363 aa31.89■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAAR9Q96RI9 348 aa31.89■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP31.89■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa31.89■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCBD2Q9H0N5 130 aa31.89■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP31.89■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC39A1Q9NY26 324 aa31.89■■■□□ 2.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 CTIFO43310 598 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCNDBP1O95273 360 aa31.88■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 EBLN1P0CF75 366 aa31.88■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOLR1P15328 257 aa31.88■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 GLRBP48167 497 aa31.88■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACY1Q03154 408 aa31.88■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXM1Q08050 763 aa31.88■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 NAA25Q14CX7 972 aa31.88■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa31.88■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM164Q5U3C3 297 aa31.88■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa31.88■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 ICE2Q659A1 982 aa31.88■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP31.88■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLEC14AQ86T13 490 aa31.88■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACMSDQ8TDX5 336 aa31.88■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZUFSPQ96AP4 578 aa31.88■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 RHBDF1Q96CC6 855 aa31.88■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR6C1Q96RD1 312 aa31.88■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATOH8Q96SQ7 321 aa31.88■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 SGPP1Q9BX95 441 aa31.88■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 B3GNT4Q9C0J1 378 aa31.88■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASCL3Q9NQ33 180 aa31.88■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCF3Q9NUQ8 709 aa31.88■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLAAQ9Y263 795 aa31.88■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLK4Q9Y5K2 254 aa31.88■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 MSL3P1P0C860 447 aa31.87■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNC1P48547 511 aa31.87■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYP4F3Q08477 520 aa31.87■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZIC1Q15915 447 aa31.87■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCAIMQ8N3R3 496 aa31.87■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSNARE1Q96NA8 513 aa31.87■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 DDA1Q9BW61 102 aa31.87■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP31.87■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 THSD1Q9NS62 852 aa31.87■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCMTD2Q9NV79 361 aa31.87■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 SYCE1LA8MT33 242 aa31.86■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDRT15L2A8MXV6 281 aa31.86■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 TARM1B6A8C7 271 aa31.86■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRAMEF10O60809 474 aa31.86■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms