RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555542.5

PRKCH-216, Transcript of protein kinase C eta, humanhuman

TSL 4

Gene PRKCH, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCH-216ENST00000555542 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 CUL1Q13616 776 aa23.45■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 NAA25Q14CX7 972 aa23.45■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 IGFBP7Q16270 282 aa23.45■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 CYP2A13Q16696 494 aa23.45■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 IP6K3Q96PC2 410 aa23.45■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 FAM167BQ9BTA0 163 aa23.45■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 CUTCQ9NTM9 273 aa23.45■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 CCDC88CQ9P219 2028 aa23.44■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 A0A0J9YVX5 310 aa23.44■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 SYF2O95926 243 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 PCGF5Q86SE9 256 aa23.44■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 MRGPREQ86SM8 312 aa23.44■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 OR2A1Q8NGT9 310 aa23.44■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 OR2Y1Q8NGV0 311 aa23.44■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 SMPDL3AQ92484 453 aa23.44■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 KCNJ9Q92806 393 aa23.44■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 SIGLEC10Q96LC7 697 aa23.44■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa23.44■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa23.44■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 ZNF839A8K0R7 811 aa23.43■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 DSCR3O14972 297 aa23.43■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 CTSVO60911 334 aa23.43■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 PGAM1P18669 254 aa23.43■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 MPP1Q00013 466 aa23.43■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa23.43■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 SUSD1Q6UWL2 747 aa23.43■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 NEK10Q6ZWH5 1172 aa23.43■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 KCNMB4Q86W47 210 aa23.43■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP23.43■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 FDCSPQ8NFU4 85 aa23.43■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 PTERQ96BW5 349 aa23.43■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 CAPZA3Q96KX2 299 aa23.43■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 SLC30A3Q99726 388 aa23.43■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 ABCF3Q9NUQ8 709 aa23.43■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 GPR83Q9NYM4 423 aa23.43■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 FBXO5Q9UKT4 447 aa23.43■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 COMMD10Q9Y6G5 202 aa23.43■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 TENM4Q6N022 2769 aa23.42■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 A0A1W2PPV9 198 aa23.42■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 MYO1CO00159 1063 aa23.42■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 VPS26AO75436 327 aa23.42■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 ERVK-10P10266 1014 aa23.42■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 MLLT10P55197 1068 aa23.42■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 FOXK1P85037 733 aa23.42■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 RAPSNQ13702 412 aa23.42■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 PTK6Q13882 451 aa23.42■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 FAM214AQ32MH5 1076 aa23.42■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 WASHC2DQ5SRD0 308 aa23.42■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 CLEC1AQ8NC01 280 aa23.42■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 INPP5DQ92835 1189 aa23.42■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 PKP4Q99569 1192 aa23.42■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 GPR21Q99679 349 aa23.42■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 DPH7Q9BTV6 452 aa23.42■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 MED13Q9UHV7 2174 aa23.42■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 TTLL8A6PVC2 850 aa23.41■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 IGHEP01854 428 aa23.41■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 HSD17B2P37059 387 aa23.41■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 PNLIPRP1P54315 467 aa23.41■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 FOXL2P58012 376 aa23.41■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 ARHGAP19Q14CB8 494 aa23.41■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 FRMPD2BQ6IN97 320 aa23.41■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 ZNF549Q6P9A3 640 aa23.41■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 GIMAP7Q8NHV1 300 aa23.41■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 FKBP10Q96AY3 582 aa23.41■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 NUDT9Q9BW91 350 aa23.41■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 KLHL42Q9P2K6 505 aa23.41■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 PLAAQ9Y263 795 aa23.41■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa23.41■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 HYKKA2RU49 373 aa23.4■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 ZBTB14O43829 449 aa23.4■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 NRP2O60462 931 aa23.4■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 DPM1O60762 260 aa23.4■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 CEACAM4O75871 244 aa23.4■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 HAUS5O94927 633 aa23.4■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 CCNDBP1O95273 360 aa23.4■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 MPC1LP0DKB6 136 aa23.4■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 ERGP11308 486 aa23.4■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 GNG11P61952 73 aa23.4■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 CRYMQ14894 314 aa23.4■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 NADK2Q4G0N4 442 aa23.4■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PRKCH-216ENST00000555542 RNF44Q7L0R7 432 aa23.4■■□□□ 1.34
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