RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546076.5

TSPAN11-204, Transcript of tetraspanin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TSPAN11, Length 1,058 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN11-204ENST00000546076 HGH1Q9BTY7 390 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 POMT2Q9UKY4 750 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 C2orf74A8MZ97 194 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 BTN3A3O00478 584 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 BTN3A1O00481 513 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 TP73O15350 636 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 RRADP55042 308 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 CTBP1Q13363 440 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 GBX1Q14549 363 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 HIF1AQ16665 826 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 KYNUQ16719 465 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 PTCHD3Q3KNS1 767 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 BBS9Q3SYG4 887 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 TTC23LQ6PF05 361 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 FAM198BQ6UWH4 519 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 UNC5AQ6ZN44 842 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 KCNMB4Q86W47 210 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 DENND6AQ8IWF6 608 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 FOPNLQ96NB1 174 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 CCDC68Q9H2F9 335 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 PCMTD2Q9NV79 361 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 FBXO5Q9UKT4 447 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 SRPK3Q9UPE1 567 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 ICKQ9UPZ9 632 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 BTRCQ9Y297 605 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 TEX264Q9Y6I9 313 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 CENPEQ02224 2701 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 GSAPA4D1B5 854 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 E5RI56 91 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 MAP3K7O43318 606 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 NIPSNAP2O75323 286 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 MSL3P1P0C860 447 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 TPBGLP0DKB5 382 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 CCNFP41002 786 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 ELK3P41970 407 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 SLC1A2P43004 574 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 RPL21P46778 160 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 RAB28P51157 221 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 ZNF789Q5FWF6 425 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 KIAA0408Q6ZU52 694 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 IGDCC3Q8IVU1 814 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 CNTN4Q8IWV2 1026 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 SYTL1Q8IYJ3 562 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 OR1L3Q8NH93 324 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 MAGEC3Q8TD91 643 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 KCNJ9Q92806 393 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 PITPNM3Q9BZ71 974 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 TRIM31Q9BZY9 425 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 XKR8Q9H6D3 395 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 SYTL2Q9HCH5 934 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 WHRNQ9P202 907 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 C5AR2Q9P296 337 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 SNX24Q9Y343 169 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 PCSK5Q92824 1860 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN11-204ENST00000546076 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 TMEM150CB9EJG8 249 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 E7ESA3 106 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 MATN4O95460 622 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 ERVK-10P10266 1014 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 CDH3P22223 829 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 OTX2P32243 289 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 CLCN7P51798 805 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 CALCOCO2Q13137 446 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 KIR2DS3Q14952 304 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 NCF4Q15080 339 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 TTLL9Q3SXZ7 439 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 NEK10Q6ZWH5 1172 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 GALNT7Q86SF2 657 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 CFAP61Q8NHU2 1237 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 RAD51AP1Q96B01 352 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 FANCEQ9HB96 536 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 ACTR10Q9NZ32 417 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 CDC23Q9UJX2 597 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 RAD51CO43502 376 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 BANF1O75531 89 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 HAUS5O94927 633 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 C1orf105O95561 183 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 CYP2A7P20853 494 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-204ENST00000546076 CD9P21926 228 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms