RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 ST6GAL1P15907 406 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 HRH2P25021 359 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 HSD17B3P37058 310 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 MAGEA12P43365 314 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 RASA2Q15283 850 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 TSNQ15631 228 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 AGTRAPQ6RW13 159 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 TIFABQ6ZNK6 161 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 TAX1BP1Q86VP1 789 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 OR2A1Q8NGT9 310 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 USP7Q93009 1102 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A1W2PPV9 198 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 TRIM49D1C9J1S8 452 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 FOXM1Q08050 763 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 TUBB3Q13509 450 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 PPP1R3BQ86XI6 285 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 TDRPQ86YL5 185 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 GPSM1Q86YR5 675 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 MREGQ8N565 214 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 OR2L3Q8NG85 312 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 FGF11Q92914 225 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 TSNARE1Q96NA8 513 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 OR6C1Q96RD1 312 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 RARRES3Q9UL19 164 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 KLHL2O95198 593 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 NUDT17P0C025 328 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 C1QTNF9P0C862 333 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 FGF5P12034 268 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 ETV5P41161 510 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 ACAP2Q15057 778 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 LCA5Q86VQ0 697 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 SPNS2Q8IVW8 549 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 RHEBL1Q8TAI7 183 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 MIPEPQ99797 713 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 EGFL8Q99944 293 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 HAUS8Q9BT25 410 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 FGF21Q9NSA1 209 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 ADAMTS20P59510 1910 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 KRT87PA6NCN2 255 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 SYCE1LA8MT33 242 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 GUCA1CO95843 209 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 S100BP04271 92 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 EBLN1P0CF75 366 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 GCAP28676 217 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC5A2P31639 672 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 TBPL1P62380 186 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 TGFBIQ15582 683 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 ICE2Q659A1 982 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 SUSD1Q6UWL2 747 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 TRIM73Q86UV7 250 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 OR56A3Q8NH54 315 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 MDM1Q8TC05 714 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 PPM1MQ96MI6 270 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 VPS11Q9H270 941 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 RNF112Q9ULX5 631 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 AKAP13Q12802 2813 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-212ENST00000508338 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-212ENST00000508338 AGRPO00253 132 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-212ENST00000508338 CDH16O75309 829 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-212ENST00000508338 ERLIN1O75477 346 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-212ENST00000508338 PVRP15151 417 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-212ENST00000508338 FOLR1P15328 257 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-212ENST00000508338 MAGP20916 626 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-212ENST00000508338 SH3BP2P78314 561 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-212ENST00000508338 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-212ENST00000508338 FIGLAQ6QHK4 219 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-212ENST00000508338 ISCA2Q86U28 154 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-212ENST00000508338 ACMSDQ8TDX5 336 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-212ENST00000508338 MED8Q96G25 268 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-212ENST00000508338 SGPP1Q9BX95 441 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-212ENST00000508338 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-212ENST00000508338 IGSF5Q9NSI5 407 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-212ENST00000508338 TAC3Q9UHF0 121 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-212ENST00000508338 SERTAD3Q9UJW9 196 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-212ENST00000508338 IKZF3Q9UKT9 509 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-212ENST00000508338 SNX7Q9UNH6 387 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-212ENST00000508338 PMS2P1A4D2B8 440 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP2-212ENST00000508338 C9orf172C9J069 976 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP2-212ENST00000508338 PRAMEF10O60809 474 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP2-212ENST00000508338 KERAO60938 352 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP2-212ENST00000508338 IPO13O94829 963 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
SH3BP2-212ENST00000508338 CAPNS1P04632 268 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP2-212ENST00000508338 TFEBP19484 476 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP2-212ENST00000508338 GRIA3P42263 894 aa25.81■■□□□ 1.72
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