RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	RBBP7	Q16576	425 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	BCL7A	Q4VC05	210 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	NPNT	Q6UXI9	565 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	PLD5	Q8N7P1	536 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	DLG3	Q92796	817 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	RELT	Q969Z4	430 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	NACC2	Q96BF6	587 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	TADA1	Q96BN2	335 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	RHOV	Q96L33	236 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM60A	Q9NP50	221 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	SMOX	Q9NWM0	555 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	SPTB	P11277	2137 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	PCSK5	Q92824	1860 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	ITPR3	Q14573	2671 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	DYTN	A2CJ06	578 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC78	A2IDD5	438 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	C2orf81	A6NN90	581 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	DIAPH2	O60879	1101 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	PGR	P06401	933 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	UGT2B7	P16662	529 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPN3	P26045	913 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	CASP6	P55212	293 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPRCAP	Q14761	206 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	RPTN	Q6XPR3	784 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC120	Q96HB5	630 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	TEKT5	Q96M29	485 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	NRTN	Q99748	197 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	COG4	Q9H9E3	785 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0J9YY10	115 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	UNC5C	O95185	931 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	EPO	P01588	193 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT1	P04264	644 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPING1	P05155	500 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	ITGAX	P20702	1163 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SSTR2	P30874	369 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SHMT2	P34897	504 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	PRLHR	P49683	370 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	TMPRSS15	P98073	1019 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	RBPJ	Q06330	500 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	MFAP5	Q13361	173 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	MESD	Q14696	234 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC1A5	Q15758	541 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	KDELC1	Q6UW63	502 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	PID1	Q7Z2X4	250 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	NR4A3	Q92570	626 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	ULK4	Q96C45	1275 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	COPS8	Q99627	209 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	ARL5A	Q9Y689	179 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SKAP2-209	ENST00000497511	SVIL	O95425	2214 aa		10.39	□□□□□ -0.75

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