RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497453.1

UBE2Q1-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2Q1, Length 830 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-207ENST00000497453 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 FMO2Q99518 471 aa17.18■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 TSPYL1Q9H0U9 437 aa17.18■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 PARVBQ9HBI1 364 aa17.18■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa17.18■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 DSPP15924 2871 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 MT-ND3P03897 115 aa17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 WT1P19544 449 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 IMPA1P29218 277 aa17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 SLC12A2P55011 1212 aa17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 ITGA1P56199 1179 aa17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 POU4F1Q01851 419 aa17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP17.17■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 39.1
UBE2Q1-207ENST00000497453 PHKG1Q16816 387 aa17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 GRTP1Q5TC63 336 aa17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 GPR155Q7Z3F1 870 aa17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 LRRN4CLQ8ND94 238 aa17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZUFSPQ96AP4 578 aa17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCDC138Q96M89 665 aa17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 GPR22Q99680 433 aa17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 ACAT2Q9BWD1 397 aa17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 CAB39LQ9H9S4 337 aa17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 POPDC3Q9HBV1 291 aa17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 IKZF3Q9UKT9 509 aa17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 TARM1B6A8C7 271 aa17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 E7EQ34 232 aa17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 H3BMH7 237 aa17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 FAM155BO75949 473 aa17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 CTSBP07858 339 aa17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 RHOXF2BP0C7M4 288 aa17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCNYL3P0C7X3 344 aa17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 CMPK1P30085 196 aa17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 SPRP35270 261 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 YBX1P67809 324 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 NAB1Q13506 487 aa17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 IFT20Q8IY31 132 aa17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 SLC38A9Q8NBW4 561 aa17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 ANKRD49Q8WVL7 239 aa17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 RHOXF2Q9BQY4 288 aa17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 L2HGDHQ9H9P8 463 aa17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 GPAMQ9HCL2 828 aa17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 SLC6A20Q9NP91 592 aa17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 LHX9Q9NQ69 397 aa17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 TAC3Q9UHF0 121 aa17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 PADI1Q9ULC6 663 aa17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 PLCL2Q9UPR0 1127 aa17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 KLK4Q9Y5K2 254 aa17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 HIST1H2ADP20671 130 aa17.15■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 PHBP35232 272 aa17.15■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 GPS2Q13227 327 aa17.15■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 USP10Q14694 798 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 ICE2Q659A1 982 aa17.15■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 GPR135Q8IZ08 494 aa17.15■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 TSPAN17Q96FV3 270 aa17.15■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa17.15■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 LRFN5Q96NI6 719 aa17.15■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 HIST1H2AJQ99878 128 aa17.15■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 H2AFJQ9BTM1 129 aa17.15■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 DPH7Q9BTV6 452 aa17.15■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 ABCF3Q9NUQ8 709 aa17.15■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 EURLQ9NYK6 297 aa17.15■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 CROTQ9UKG9 612 aa17.15■□□□□ 0.34
UBE2Q1-207ENST00000497453 CDC7O00311 574 aa17.14■□□□□ 0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 TERTO14746 1132 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF749O43361 778 aa17.14■□□□□ 0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 NRP2O60462 931 aa17.14■□□□□ 0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 CTSVO60911 334 aa17.14■□□□□ 0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 OR2B3O76000 313 aa17.14■□□□□ 0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCNDBP1O95273 360 aa17.14■□□□□ 0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 DLSTP36957 453 aa17.14■□□□□ 0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 NAA25Q14CX7 972 aa17.14■□□□□ 0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 AGTRAPQ6RW13 159 aa17.14■□□□□ 0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa17.14■□□□□ 0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 ANKRD7Q92527 254 aa17.14■□□□□ 0.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 CLIP3Q96DZ5 547 aa17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms