RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495653.1

PTPN23-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 23, human

TSL 2

Gene PTPN23, Length 676 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN23-205	ENST00000495653	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	PCM1	Q15154	2024 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	MGA	Q8IWI9	3026 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653		H3BMH7	237 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	NKX2-8	O15522	239 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	ZNF749	O43361	778 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	KATNA1	O75449	491 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	C1QA	P02745	245 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	PRKAR1A	P10644	381 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	TCN2	P20062	427 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	IL2	P60568	153 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	RHD	Q02161	417 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	DNASE1L3	Q13609	305 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	ZNF460	Q14592	562 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	PHKG1	Q16816	387 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	LCN10	Q6JVE6	187 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	GPR135	Q8IZ08	494 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	STARD8	Q92502	1023 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	TTC9	Q92623	222 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	CDKL2	Q92772	493 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	MR1	Q95460	341 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	VPS39	Q96JC1	886 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	EURL	Q9NYK6	297 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	TAC3	Q9UHF0	121 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	PDE10A	Q9Y233	779 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	FAM159B	A6NKW6	160 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653		E7ENX8	843 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	MEN1	O00255	615 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	CTSV	O60911	334 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	FKBP9	O95302	570 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	C8G	P07360	202 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	GSTA2	P09210	222 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	IMPA1	P29218	277 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	CMPK1	P30085	196 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	RORA	P35398	523 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	HSD17B2	P37059	387 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	TAS2R39	P59534	338 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	TAP2	Q03519	686 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	SP140	Q13342	867 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	C16orf46	Q6P387	395 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	CEP97	Q8IW35	865 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	EXTL1	Q92935	676 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	DPH7	Q9BTV6	452 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	CHST8	Q9H2A9	424 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	PARVB	Q9HBI1	364 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653		A0A0J9YVX5	310 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	ZNF839	A8K0R7	811 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	TARM1	B6A8C7	271 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	SLC16A5	O15375	505 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	CDC20	Q12834	499 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	13.42	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	C1orf189	Q5VU69	101 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	ICE2	Q659A1	982 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPN23-205	ENST00000495653	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26

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