RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489603.5

LRRFIP1-214, Transcript of LRR binding FLII interacting protein 1, human

TSL 3

Gene LRRFIP1, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ANXA9	O76027	345 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	FTCD	O95954	541 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	FGG	P02679	453 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	MYOG	P15173	224 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	PSMC3	P17980	439 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	GJC1	P36383	396 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	DNA2	P51530	1060 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	CDH15	P55291	814 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	HSD17B7	P56937	341 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	CDK16	Q00536	496 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	PDE1B	Q01064	536 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	MTF1	Q14872	753 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	C5orf22	Q49AR2	442 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	FBXO43	Q4G163	708 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ZNF766	Q5HY98	468 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	C8orf74	Q6P047	294 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	C11orf88	Q6PI97	169 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	FAM131B	Q86XD5	332 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	PTP4A1	Q93096	173 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	VPS33A	Q96AX1	596 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	FBXL20	Q96IG2	436 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	B3GALT6	Q96L58	329 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	WDR24	Q96S15	920 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	RUFY1	Q96T51	708 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	PIP5K1A	Q99755	562 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	NAT9	Q9BTE0	207 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ACP6	Q9NPH0	428 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	DYRK4	Q9NR20	520 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	PAK5	Q9P286	719 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	DEC1	Q9P2X7	70 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	SUN2	Q9UH99	717 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	FZD10	Q9ULW2	581 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	CPQ	Q9Y646	472 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	SI	P14410	1827 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	WDR81	Q562E7	1941 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ILVBL	A1L0T0	632 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	HHLA1	C9JL84	531 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603		E9PAM4	449 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	SGK1	O00141	431 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	TAF4	O00268	1085 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	COCH	O43405	550 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	CBFA2T3	O75081	653 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	RASAL1	O95294	804 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	OR2C1	O95371	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	SEC24A	O95486	1093 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	APOD	P05090	189 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	RHOC	P08134	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	HMBS	P08397	361 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	EPCAM	P16422	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ATF6	P18850	670 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	PRKCH	P24723	683 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	CCNC	P24863	283 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	PHB	P35232	272 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	FDFT1	P37268	417 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	DR1	Q01658	176 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	CUL1	Q13616	776 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ZNF235	Q14590	738 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	SLMAP	Q14BN4	828 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRFIP1-214	ENST00000489603	TCTN1	Q2MV58	587 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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