RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNC4	Q03721	635 aa		16.64	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	KLRB1	Q12918	225 aa		16.64	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		16.64	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	16.64	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		16.64	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	VRK3	Q8IV63	474 aa		16.64	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	DLG3	Q92796	817 aa		16.64	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		16.64	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		16.64	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	16.64	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		16.64	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		16.64	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		16.64	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		16.64	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ISM1	B1AKI9	464 aa		16.63	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424		C9J4A7	227 aa		16.63	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	16.63	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHL41	O60662	606 aa		16.63	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	16.63	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2B3	O76000	313 aa		16.63	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	MATN4	O95460	622 aa		16.63	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	HSD17B2	P37059	387 aa		16.63	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGEA4	P43358	317 aa		16.63	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ARSF	P54793	590 aa		16.63	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		16.63	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	TCTE1	Q5JU00	501 aa		16.63	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		16.63	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		16.63	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	MED25	Q71SY5	747 aa		16.63	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		16.63	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	16.63	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		16.63	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	16.63	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	FMO2	Q99518	471 aa		16.63	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	CLMP	Q9H6B4	373 aa		16.63	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		16.63	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM60A	Q9NP50	221 aa		16.63	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	16.63	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		16.63	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	16.63	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	BSN	Q9UPA5	3926 aa		16.63	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	IQCF5	A8MTL0	148 aa		16.62	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf105	O95561	183 aa		16.62	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	PVR	P15151	417 aa		16.62	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	PHB	P35232	272 aa		16.62	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	16.62	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	GCGR	P47871	477 aa		16.62	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	RRAD	P55042	308 aa		16.62	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	16.62	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SSPN	Q14714	243 aa		16.62	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	NCF4	Q15080	339 aa		16.62	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ZIC1	Q15915	447 aa		16.62	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		16.62	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		16.62	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		16.62	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		16.62	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		16.62	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	GALNT7	Q86SF2	657 aa		16.62	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		16.62	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	KRT222	Q8N1A0	295 aa		16.62	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		16.62	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	16.62	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		16.62	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	16.62	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		16.62	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM4	Q9C037	500 aa		16.62	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SNX7	Q9UNH6	387 aa		16.62	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	VPS26A	O75436	327 aa		16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	CEACAM4	O75871	244 aa		16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	HAUS5	O94927	633 aa		16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	STX2	P32856	288 aa		16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	RELA	Q04206	551 aa		16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	TRADD	Q15628	312 aa		16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP2A13	Q16696	494 aa		16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	CYS1	Q717R9	158 aa		16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB43	Q86YS6	212 aa		16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNJ9	Q92806	393 aa		16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	GBP5	Q96PP8	586 aa		16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	NRTN	Q99748	197 aa		16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	EURL	Q9NYK6	297 aa		16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	TLK1	Q9UKI8	766 aa		16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SPTB	P11277	2137 aa		16.61	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SEC16A	O15027	2179 aa		16.6	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF839	A8K0R7	811 aa		16.6	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	16.6	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ALB	P02768	609 aa		16.6	■□□□□ 0.25

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