RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486388.5

UBP1-210, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 3

Gene UBP1, Length 928 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-210	ENST00000486388	STX1A	Q16623	288 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CYP2A13	Q16696	494 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	KIF18B	Q86Y91	864 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	D2HGDH	Q8N465	521 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GPR26	Q8NDV2	337 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	LCN9	Q8WX39	176 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	MAML1	Q92585	1016 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	LRRC45	Q96CN5	670 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	C12orf66	Q96MD2	445 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	AGAP3	Q96P47	875 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SMIM14	Q96QK8	99 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	WDR24	Q96S15	920 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TTC1	Q99614	292 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	NUDT9	Q9BW91	350 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TLR10	Q9BXR5	811 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TRIM7	Q9C029	511 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TRABD	Q9H4I3	376 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GP6	Q9HCN6	339 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	HACD3	Q9P035	362 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF711	Q9Y462	761 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388		A0A1B0GTL3	188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388		A0A1B0GUH1	482 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SMTNL1	A8MU46	457 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	C2orf74	A8MZ97	194 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	KCNK1	O00180	336 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	APOL1	O14791	398 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	OR2B3	O76000	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	NDST3	O95803	873 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SERPINC1	P01008	464 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SCG5	P05408	212 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	UQCRH	P07919	91 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PIRT	P0C851	137 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	MYBL2	P10244	700 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	BPI	P17213	487 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	HLA-DPA1	P20036	260 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	MSH3	P20585	1137 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	HMGCL	P35914	325 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SPAM1	P38567	509 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TPM4	P67936	248 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	DMPK	Q09013	629 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CDC16	Q13042	620 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	DPYSL3	Q14195	570 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	NCF4	Q15080	339 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	MLIP	Q5VWP3	458 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	METRNL	Q641Q3	311 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	FCRL6	Q6DN72	434 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	MTFR2	Q6P444	385 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GALNT16	Q8N428	558 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms