RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-202ENST00000483873 MAP3K7O43318 606 aa25.5■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 ACSL3O95573 720 aa25.5■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 MSL3P1P0C860 447 aa25.5■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 POU4F1Q01851 419 aa25.5■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 GRTP1Q5TC63 336 aa25.5■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 FCRL6Q6DN72 434 aa25.5■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 SYTL1Q8IYJ3 562 aa25.5■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 NLGN4XQ8N0W4 816 aa25.5■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 GALNT6Q8NCL4 622 aa25.5■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 OR2L3Q8NG85 312 aa25.5■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 PARVBQ9HBI1 364 aa25.5■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 E7ENX8 843 aa25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC16A5O15375 505 aa25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 EFSO43281 561 aa25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 NRP2O60462 931 aa25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 NTRK1P04629 796 aa25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 CTSBP07858 339 aa25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 ATP1A2P50993 1020 aa25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC12A2P55011 1212 aa25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 TAP2Q03519 686 aa25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 NAB1Q13506 487 aa25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 USP10Q14694 798 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 MANEAQ5SRI9 462 aa25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 WDR93Q6P2C0 686 aa25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 FIGLAQ6QHK4 219 aa25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 IL22RA1Q8N6P7 574 aa25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 MCOLN3Q8TDD5 553 aa25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 GPAMQ9HCL2 828 aa25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 ABCF3Q9NUQ8 709 aa25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 SCRG1O75711 98 aa25.48■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 PHBP35232 272 aa25.48■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 SPRP35270 261 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 HSD17B2P37059 387 aa25.48■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 GRIA3P42263 894 aa25.48■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 TMEM126BQ8IUX1 230 aa25.48■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 DNAJC22Q8N4W6 341 aa25.48■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 OR8K5Q8NH50 307 aa25.48■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 FCRL4Q96PJ5 515 aa25.48■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 POPDC3Q9HBV1 291 aa25.48■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 SYTL2Q9HCH5 934 aa25.48■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC6A20Q9NP91 592 aa25.48■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 TAC3Q9UHF0 121 aa25.48■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa25.47■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF839A8K0R7 811 aa25.47■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 CDC7O00311 574 aa25.47■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 WT1P19544 449 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 GMPRP36959 345 aa25.47■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 TMPRSS3P57727 454 aa25.47■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 CCDC138Q96M89 665 aa25.47■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 PARD6BQ9BYG5 372 aa25.47■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 ACSS3Q9H6R3 686 aa25.47■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 LOC400499M0QZD8 3231 aa25.47■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 FKBP9O95302 570 aa25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 CXADRP78310 365 aa25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 MAP7Q14244 749 aa25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 SLMAPQ14BN4 828 aa25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 SBSNQ6UWP8 590 aa25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC38A9Q8NBW4 561 aa25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 TSPAN17Q96FV3 270 aa25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 CYTH2Q99418 400 aa25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 FUT8Q9BYC5 575 aa25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 FER1L5A0AVI2 2057 aa25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 H3BMH7 237 aa25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 LIFP15018 202 aa25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 STMN1P16949 149 aa25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 CMPK1P30085 196 aa25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 ITGA1P56199 1179 aa25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 TBPL1P62380 186 aa25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 CMC1Q7Z7K0 106 aa25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 SPATA6LQ8N4H0 392 aa25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 ESX1Q8N693 406 aa25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 TXLNGYQ9BZA5 131 aa25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 ATG10Q9H0Y0 220 aa25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 PRORYQ9H606 182 aa25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4-202ENST00000483873 SERTAD3Q9UJW9 196 aa25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms