RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 POLQO75417 2590 aa5.46□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 CACNA1EQ15878 2313 aa5.46□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 FOCADQ5VW36 1801 aa5.46□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 SMIM30A4D0T7 59 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 C2CD4DB7Z1M9 353 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 STMND1H3BQB6 276 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 PPP6CO00743 305 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 RTN2O75298 545 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 PNPP00491 289 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 MMP3P08254 477 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 INHBAP08476 426 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 LINC00271P0C7V0 271 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 GAP43P17677 238 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 WT1P19544 449 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 HPDP32754 393 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 CASP3P42574 277 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 LIMK1P53667 647 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 HSF1Q00613 529 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 GRIK2Q13002 908 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 SFMBT2Q5VUG0 894 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 GGNBP1Q5YKI7 109 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM198BQ6UWH4 519 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 NHLRC1Q6VVB1 395 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF813Q6ZN06 617 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM57BQ71RH2 274 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 SPATA21Q7Z572 469 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 TRIML1Q8N9V2 468 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 ROBO4Q8WZ75 1007 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 APBB2Q92870 758 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 GRAMD2BQ96HH9 432 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 RMDN2Q96LZ7 410 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 UROC1Q96N76 676 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 EGFL8Q99944 293 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC5A7Q9GZV3 580 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 RCOR1Q9UKL0 485 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 TMCC3Q9ULS5 477 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 DENND4AQ7Z401 1863 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 KAT6AQ92794 2004 aa5.45□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 OOEPA6NGQ2 149 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 C5orf67F2Z3F1 127 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 ST8SIA3O43173 380 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 PRAMEF11O60813 436 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 SEC22BO75396 215 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 NDUFB4O95168 129 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 IGHDP01880 384 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 CXCL10P02778 98 aa5.44□□□□□ -1.54
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STRADBP1-201ENST00000478954 MYZAPP0CAP1 466 aa5.44□□□□□ -1.54
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STRADBP1-201ENST00000478954 CDC25CP30307 473 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 PTENP60484 403 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 ASIC1P78348 528 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 CFHR1Q03591 330 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 STIM1Q13586 685 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC158Q5M9N0 1113 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 WDR73Q6P4I2 378 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 FIGLAQ6QHK4 219 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 MOXD1Q6UVY6 613 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 BEST3Q8N1M1 668 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 TEX45Q8NA69 505 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 UXS1Q8NBZ7 420 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 VN1R2Q8NFZ6 395 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC9A6Q92581 669 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 RHBDF1Q96CC6 855 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 NLRP4Q96MN2 994 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 MS4A10Q96PG2 267 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 SH2D3AQ9BRG2 576 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 S1PR5Q9H228 398 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 TNMDQ9H2S6 317 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 KLHL31Q9H511 634 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM206Q9H813 350 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 PDRG1Q9NUG6 133 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 STK39Q9UEW8 545 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 ACSL5Q9ULC5 683 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 SQORQ9Y6N5 450 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa5.44□□□□□ -1.54
STRADBP1-201ENST00000478954 NAV1Q8NEY1 1877 aa5.43□□□□□ -1.54
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