RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466141.1

RPUSD3-212, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 996 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-212ENST00000466141 NXPH1P58417 271 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 RAB4BP61018 213 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 RPP30P78346 268 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 PRAMEP78395 509 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 ECT2LQ008S8 904 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 GNA12Q03113 381 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 PPARDQ03181 441 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 ILKQ13418 452 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 RCN2Q14257 317 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 ZMYND11Q15326 602 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 NPTX1Q15818 432 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 C9orf64Q5T6V5 341 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 C1orf185Q5T7R7 199 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 SCYL2Q6P3W7 929 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 CASC4Q6P4E1 433 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 PTCHD4Q6ZW05 846 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 H2AFVQ71UI9 128 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 UTS2BQ765I0 119 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 FJX1Q86VR8 437 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 NLRP8Q86W28 1048 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 SH2D3CQ8N5H7 860 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 HIPK4Q8NE63 616 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 OR7D4Q8NG98 312 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 LHFPL5Q8TAF8 219 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 POC1BQ8TC44 478 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 BTN2A2Q8WVV5 523 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 PMEPA1Q969W9 287 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 PTERQ96BW5 349 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 GRAMD1AQ96CP6 724 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 SERAC1Q96JX3 654 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 RANBP9Q96S59 729 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 SPATA16Q9BXB7 569 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 NEUROG2Q9H2A3 272 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 ASCL3Q9NQ33 180 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 UCKL1Q9NWZ5 548 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 ADPRHL2Q9NX46 363 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 FBXL12Q9NXK8 326 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 ACTR3BQ9P1U1 418 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 AASSQ9UDR5 926 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 CDC23Q9UJX2 597 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 RPS6KA6Q9UK32 745 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 VPS28Q9UK41 221 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF175Q9Y473 711 aa7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 MAGEA13PA6NCF6 341 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 OR5K3A6NET4 321 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 A8MX80 341 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 F5H0A9 414 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 K7ENP7 123 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 TLR4O00206 839 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 GNB5O14775 395 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 MID1O15344 667 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 TP73O15350 636 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 CSO75390 466 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 PROSCO94903 275 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 NDUFA10O95299 355 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 GSTA1P08263 222 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 SRCP12931 536 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 ACADSP16219 412 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 BPIP17213 487 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 ITGB6P18564 788 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 EPHB2P29323 1055 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 ACVRL1P37023 503 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 MSH2P43246 934 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 ARFIP2P53365 341 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 TPI1P60174 286 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 PPP2CBP62714 309 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 PPP2CAP67775 309 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 ARF5P84085 180 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 CCZ1BP86790 482 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 RAD51Q06609 339 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 TUBB2AQ13885 445 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 PHKG1Q16816 387 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 SMTNL2Q2TAL5 461 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 CNPY1Q3B7I2 92 aa7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RPUSD3-212ENST00000466141 ERMARDQ5T6L9 678 aa7.14□□□□□ -1.27
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