RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460308.6

ABCD4-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,003 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-202ENST00000460308 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa20.62■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa20.62■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 OR2A1Q8NGT9 310 aa20.62■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 OR1L3Q8NH93 324 aa20.62■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF480Q8WV37 535 aa20.62■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 MCMBPQ9BTE3 642 aa20.62■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 POPDC3Q9HBV1 291 aa20.62■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 ABCF3Q9NUQ8 709 aa20.62■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 NINJ2Q9NZG7 142 aa20.62■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 LHX6Q9UPM6 363 aa20.62■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 PLCL2Q9UPR0 1127 aa20.62■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 SSUH2Q9Y2M2 353 aa20.62■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 A0A1W2PPV9 198 aa20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 TARM1B6A8C7 271 aa20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 E7ENX8 843 aa20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 E7EQ34 232 aa20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 KRT37O76014 449 aa20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 CCNDBP1O95273 360 aa20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 C1QAP02745 245 aa20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 TAP2Q03519 686 aa20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF460Q14592 562 aa20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 DEFB110Q30KQ9 67 aa20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 ARHGAP40Q5TG30 622 aa20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 CEP97Q8IW35 865 aa20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 DNAJC22Q8N4W6 341 aa20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 PPFIBP2Q8ND30 876 aa20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 OR2L3Q8NG85 312 aa20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 DLG3Q92796 817 aa20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 CRELD1Q96HD1 420 aa20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 CYTH2Q99418 400 aa20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 GPR22Q99680 433 aa20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 EFHD1Q9BUP0 239 aa20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 L2HGDHQ9H9P8 463 aa20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 PADI1Q9ULC6 663 aa20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 NFU1Q9UMS0 254 aa20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa20.61■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 OR2B3O76000 313 aa20.6■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 STMN1P16949 149 aa20.6■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 IMPA1P29218 277 aa20.6■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 GRIA3P42263 894 aa20.6■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 SLMAPQ14BN4 828 aa20.6■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 TMEM207Q6UWW9 146 aa20.6■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 CLIP3Q96DZ5 547 aa20.6■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 PRORYQ9H606 182 aa20.6■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 CAB39LQ9H9S4 337 aa20.6■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 ARL15Q9NXU5 204 aa20.6■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 TAC3Q9UHF0 121 aa20.6■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa20.6■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 FAM155BO75949 473 aa20.59■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 ACSL3O95573 720 aa20.59■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 ECHS1P30084 290 aa20.59■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 AP1S2P56377 157 aa20.59■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.891e-7■■■□□ 18.5
ABCD4-202ENST00000460308 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 PHKG1Q16816 387 aa20.59■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 FCRL6Q6DN72 434 aa20.59■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 GPR155Q7Z3F1 870 aa20.59■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 ANKRD7Q92527 254 aa20.59■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 LHX9Q9NQ69 397 aa20.59■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa20.59■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa20.58■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 K7ENP7 123 aa20.58■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 EFSO43281 561 aa20.58■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 GUCA1CO95843 209 aa20.58■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 HBQ1P09105 142 aa20.58■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 LIFP15018 202 aa20.58■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 STAT5AP42229 794 aa20.58■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 GABRA4P48169 554 aa20.58■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 TEX35Q5T0J7 233 aa20.58■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa20.58■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 ICE2Q659A1 982 aa20.58■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 AGTRAPQ6RW13 159 aa20.58■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa20.58■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 MED8Q96G25 268 aa20.58■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 DPH7Q9BTV6 452 aa20.58■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 PCBD2Q9H0N5 130 aa20.58■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 ATG10Q9H0Y0 220 aa20.58■□□□□ 0.89
ABCD4-202ENST00000460308 EURLQ9NYK6 297 aa20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.7 ms