RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 HMGCLL1Q8TB92 370 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 ASB11Q8WXH4 323 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 DLG3Q92796 817 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 NAT9Q9BTE0 207 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC6A20Q9NP91 592 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 KCNMB2Q9Y691 235 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 COMMD10Q9Y6G5 202 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF462Q96JM2 2506 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 PIAS1O75925 651 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 CHAF1BQ13112 559 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 COLEC12Q5KU26 742 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 MLIPQ5VWP3 458 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 FRMPD2BQ6IN97 320 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 PAQR3Q6TCH7 311 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 NEK10Q6ZWH5 1172 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 DTWD1Q8N5C7 304 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 GPATCH11Q8N954 259 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF480Q8WV37 535 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 GPR87Q9BY21 358 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM114A2Q9NRY5 505 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 POLHQ9Y253 713 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 PSAT1Q9Y617 370 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 COL6A6A6NMZ7 2263 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 A0A0J9YVX5 310 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 DNAJB5O75953 348 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC16A8O95907 504 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 ERGP11308 486 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 NR1D1P20393 614 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 PNLIPRP1P54315 467 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 CPZQ66K79 652 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 RHBDD2Q6NTF9 364 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF605Q86T29 641 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 GBP5Q96PP8 586 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 ERP44Q9BS26 406 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 KLHL42Q9P2K6 505 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 TAC3Q9UHF0 121 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 SNX7Q9UNH6 387 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 BSNQ9UPA5 3926 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 SEC16AO15027 2179 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM187AA6NFU0 413 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 GFYI3L273 518 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 SMAPO00193 183 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 HBQ1P09105 142 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 ALAS2P22557 587 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 TRADDQ15628 312 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 UGT8Q16880 541 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 HECTD2Q5U5R9 776 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 SYVN1Q86TM6 617 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 ZBED8Q8IZ13 594 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 OR4N4Q8N0Y3 316 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 SMPDL3AQ92484 453 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 LRRC39Q96DD0 335 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 LINGO1Q96FE5 620 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 OLFM1Q99784 485 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 DPH7Q9BTV6 452 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 NDC1Q9BTX1 674 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 NLNQ9BYT8 704 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 TRIM55Q9BYV6 548 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 SYNPO2LQ9H987 977 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 TXLNGQ9NUQ3 528 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 TAS2R13Q9NYV9 303 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 GRHL1Q9NZI5 618 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 NDOR1Q9UHB4 597 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 TCFL5Q9UL49 500 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC88CQ9P219 2028 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 B8ZZF3 427 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 E7ESA3 106 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 K7EM74 188 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 RAB40ALP0C0E4 278 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 AGXTP21549 392 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 SAT1P21673 171 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 CMPK1P30085 196 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 NCF4Q15080 339 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 TLDC1Q6P9B6 456 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 TTLL10Q6ZVT0 673 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 ABHD17AQ96GS6 310 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 SELENOSQ9BQE4 189 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC25A18Q9H1K4 315 aa22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms