RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 RNF44Q7L0R7 432 aa8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 NLRP9Q7RTR0 991 aa8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 OVCH1Q7RTY7 1134 aa8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 HOOK3Q86VS8 718 aa8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR4N4Q8N0Y3 316 aa8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 LPGAT1Q92604 370 aa8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 MFSD3Q96ES6 412 aa8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 ALS2CR12Q96Q35 445 aa8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 C17orf62Q9BQA9 187 aa8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 NDC1Q9BTX1 674 aa8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIFC1Q9BW19 673 aa8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLAMF7Q9NQ25 335 aa8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 CUTCQ9NTM9 273 aa8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 TXLNGQ9NUQ3 528 aa8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 SYBUQ9NX95 663 aa8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 PAK5Q9P286 719 aa8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 NDOR1Q9UHB4 597 aa8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 GUCA1BQ9UMX6 200 aa8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 MED16Q9Y2X0 877 aa8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.09□□□□□ -1.11
GAPDHP28-201ENST00000455134 APCP25054 2843 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR2A25A4D2G3 310 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 GOLGA8KD6RF30 607 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 E7EVH7 732 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 GOLGA8TH3BQL2 631 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAP3K7O43318 606 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 MATN4O95460 622 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 LDLRP01130 860 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 ALBP02768 609 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 APOA4P06727 396 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 MGAT1P26572 445 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR1D4P47884 311 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 TTPAP49638 278 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARSFP54793 590 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCNJ11Q14654 390 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 SF1Q15637 639 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIF1AQ16665 826 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 CNSTQ6PJW8 725 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 CENPUQ71F23 418 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 IQCKQ8N0W5 287 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 SHISA5Q8N114 240 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 MPP5Q8N3R9 675 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLEC1AQ8NC01 280 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR2L3Q8NG85 312 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 GIMAP7Q8NHV1 300 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAD51AP1Q96B01 352 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 C10orf90Q96M02 699 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC30A3Q99726 388 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 WDR54Q9H977 334 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBXL4Q9UKA2 621 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 SOX13Q9UN79 622 aa8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A0J9YVX5 310 aa8.07□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 A1L4Q6 167 aa8.07□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARHGEF33A8MVX0 844 aa8.07□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 TARM1B6A8C7 271 aa8.07□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 PEX12O00623 359 aa8.07□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 KDM1AO60341 852 aa8.07□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 KLHL18O94889 574 aa8.07□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 FKBP9O95302 570 aa8.07□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 GAS8O95995 478 aa8.07□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPN2P04844 631 aa8.07□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 CD63P08962 238 aa8.07□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 TPSB2P20231 275 aa8.07□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 ALAS2P22557 587 aa8.07□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 COL8A1P27658 744 aa8.07□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAGEA6P43360 314 aa8.07□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 NPY2RP49146 381 aa8.07□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 GRM7Q14831 915 aa8.07□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 TPSAB1Q15661 275 aa8.07□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYP2A13Q16696 494 aa8.07□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRTGQ2VWP7 1150 aa8.07□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 C4orf17Q53FE4 359 aa8.07□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACSBG2Q5FVE4 666 aa8.07□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 TCTE1Q5JU00 501 aa8.07□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 WASHC2DQ5SRD0 308 aa8.07□□□□□ -1.12
GAPDHP28-201ENST00000455134 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms