RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 PACS1Q6VY07 963 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 MRGPREQ86SM8 312 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 NAT8LQ8N9F0 302 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 MCUQ8NE86 351 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 FBXO25Q8TCJ0 367 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 PROKR1Q8TCW9 393 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 LCN9Q8WX39 176 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 PEX13Q92968 403 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 NACC2Q96BF6 587 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 HGH1Q9BTY7 390 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 KIFC1Q9BW19 673 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 NDOR1Q9UHB4 597 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 RAB21Q9UL25 225 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 POLEQ07864 2286 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 SEC16AO15027 2179 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 SDR42E2A6NKP2 422 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 IQCF5A8MTL0 148 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 C2orf74A8MZ97 194 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 MYBL2P10244 700 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 PDHA2P29803 388 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 ECHS1P30084 290 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 RIPPLY3P57055 190 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 CAV1Q03135 178 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 HSPA14Q0VDF9 509 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 ABRQ12979 859 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 PRKG2Q13237 762 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 CYP2A13Q16696 494 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 MRNIPQ6NTE8 343 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 KRT222Q8N1A0 295 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 PHC3Q8NDX5 983 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 OR4E2Q8NGC2 313 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 OR1L3Q8NH93 324 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 DENND1AQ8TEH3 1009 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 C19orf60Q96EN9 201 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 PWWP2AQ96N64 755 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 FMO2Q99518 471 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 PITPNM3Q9BZ71 974 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 GNPTGQ9UJJ9 305 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 SRPK3Q9UPE1 567 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 ENTPD4Q9Y227 616 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 PFDN6O15212 129 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 TP73O15350 636 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 ZNF749O43361 778 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 KDM1AO60341 852 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 BANF1O75531 89 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 CAPN1P07384 714 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 F7P08709 466 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 GSTM1P09488 218 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 MLNP12872 115 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 FMO4P31512 558 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 GLRBP48167 497 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 SOX8P57073 446 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 DCDP81605 110 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 GSTM4Q03013 218 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 RPA4Q13156 261 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 RAPSNQ13702 412 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 TMED2Q15363 201 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 PTCHD3Q3KNS1 767 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 MLIPQ5VWP3 458 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 C1QL3Q5VWW1 255 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 FCRL6Q6DN72 434 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 ZNF470Q6ECI4 717 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 Q6ZS92 163 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 CCDC25Q86WR0 208 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 OR2Y1Q8NGV0 311 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 CFAP61Q8NHU2 1237 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 GSDMBQ8TAX9 411 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 PTERQ96BW5 349 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 FAM136AQ96C01 138 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 FAM129AQ9BZQ8 928 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 OR52A5Q9H2C5 316 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 MVB12BQ9H7P6 319 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 TXLNGQ9NUQ3 528 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 ASF1AQ9Y294 204 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
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