RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-208ENST00000436638 Q3ZCU0 254 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 MRNIPQ6NTE8 343 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 TMEM53Q6P2H8 277 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 DOK6Q6PKX4 331 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 CES3Q6UWW8 571 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 MACC1Q6ZN28 852 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 GK5Q6ZS86 529 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 CBLL1Q75N03 491 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 RD3Q7Z3Z2 195 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 SNX20Q7Z614 316 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 PARGQ86W56 976 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 NKAIN4Q8IVV8 208 aa6.05□□□□□ -1.44
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ECHDC1-208ENST00000436638 SUMF1Q8NBK3 374 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.05□□□□□ -1.44
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ECHDC1-208ENST00000436638 FBXO36Q8NEA4 188 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 OR56A4Q8NGH8 313 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 OR4L1Q8NH43 312 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 SLC22A8Q8TCC7 542 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 FBXO25Q8TCJ0 367 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 DTX3LQ8TDB6 740 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.05□□□□□ -1.44
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ECHDC1-208ENST00000436638 NINJ1Q92982 152 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 UBE2FQ969M7 185 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 EID2BQ96D98 161 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 CCDC74BQ96LY2 380 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 WDR92Q96MX6 357 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 PWWP2AQ96N64 755 aa6.05□□□□□ -1.44
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ECHDC1-208ENST00000436638 MYLK2Q9H1R3 596 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 UGT1A7Q9HAW7 530 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 UGT1A10Q9HAW8 530 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 UGT1A8Q9HAW9 530 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 IL26Q9NPH9 171 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 SDHAF3Q9NRP4 125 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
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ECHDC1-208ENST00000436638 OR1A2Q9Y585 309 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 FAM169AQ9Y6X4 670 aa6.05□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.05□□□□□ -1.44
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ECHDC1-208ENST00000436638 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa6.05□□□□□ -1.44
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ECHDC1-208ENST00000436638 NCOR1O75376 2440 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 FADS2P1A8MWK0 482 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 C10orf142B7Z368 130 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 E7ESA3 106 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 PROB1E7EW31 1015 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 K7ESM1 405 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 QSOX1O00391 747 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 TNFRSF10CO14798 259 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 VEGFDO43915 354 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 DNAJA2O60884 412 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 LRP3O75074 770 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 CBFA2T3O75081 653 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 BANF1O75531 89 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 SPAG6O75602 509 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 CDK14O94921 469 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 PLATP00750 562 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 WNT1P04628 370 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 TUBBP07437 444 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 ZNF806P0C7X5 589 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 EVI2BP34910 448 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 PHBP35232 272 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 MAGEA3P43357 314 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 MAGEA4P43358 317 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 CARSP49589 748 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 NXPH1P58417 271 aa6.04□□□□□ -1.44
ECHDC1-208ENST00000436638 SRP54P61011 504 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
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